文件名称：拼接tif影像matlab代码-TopoChip-analysis-:用于分析Topochip图像的代码
文件大小：19KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-14 08:14:24
系统开源
拼接tif影像matlab代码TopoChip分析 用于分析Topochip图像的代码 从EZ活荧光显微镜生成的图像是仅具有一个通道的单个图像，并以Batch11_A01_s2_w1.TIF的格式命名。 图像是自动聚焦的，因此不需要z堆栈。 因此，图像通过不同的通道进行分类。 然后分开缝制。 不知道缝合这些图像是什么问题。 运行1_Relocating_images.ijm 1.根据原始图像的顺序将图像组织到名为w01，w02，w03，w04，w05的不同通道文件夹中。 每次运行只能处理一个芯片数据。 运行2_Renaming_images.ijm 1.使用拼接之前原始图像的原始顺序，使用文件名格式图块{iii} .TIF重命名每个通道文件夹中的每个图像。 2.通过添加到“新阵列”列表中，可以重命名多组芯片图像。 运行3_Stitching.ijm 不要忘记在运行代码之前调整所有参数 将生成包括5个通道的堆栈图像 运行4_BackgroundSub.ijm 确保ROI文件夹（用于背景扣除）位于斐济插件文件夹下。 运行5_CropCoarse.ijm 记下日志中打印出的值； 对于下一步的
【文件预览】：
TopoChip-analysis--master
----3_Stitching.ijm(5KB)
----L4 Data rearrange_channel_selection.m(12KB)
----FullTopoChipsAnalysisPart2.m(1KB)
----1_Relocating_images.ijm(3KB)
----.gitignore(120B)
----README.md(1KB)
----FullTopoChipsAnalysisPart1.m(4KB)
----CropFine.m(7KB)
----L3 Data rearrange_channel_selection.m(12KB)
----4_CoarseCropping.ijm(4KB)
----Fine_Crop_TopochipsbyYuYang.m(2KB)
----SplitChannels.ijm(1KB)
----2_Renaming_images.ijm(2KB)
----writeTiffStackMask.m(263B)