文件名称：NIRAL_DTI_PIPELINE:执行DTI管道的Python脚本
文件大小：100KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-04 13:34:42
Python
NIRAL_DTI_PIPELINE 目录 --- 1.管道流程图 ---！[“流程图”]（ ） 上面显示的流程图表示单进程管道版本。 多进程版本和单进程版本之间的主要区别在于，多进程版本并行计算所有种子区域（即不包括顺序处理每个种子区域的循环）。 如图所示，管道定义了执行以下列出的操作序列的六个组件： DWI到DTI：这将提取去掉头骨的DWI图像，并创建DTI，RD，AD，FA和DWI-b0图像体积。 AutoSeg：使用英制图集以及T1和T2图像创建白质，灰质和CSF分割。 FDT蒙版：创建运行FDT床柱和probtrack所需的蒙版。 具体来说， no_diff_brain蒙版 航点面具 排除面具 种子面具（帝国分割中定义的每个大脑区域一个） 终端屏蔽（英制分割中定义的每个大脑区域一个） FDT床柱：执行使用采样技术（bedpostx）算法获得的FDT贝叶斯估计扩散参
【文件预览】：
NIRAL_DTI_PIPELINE-master
----autoseg.py(9KB)
----autoseg_templates()
--------AutoSeg_Computation.txt(1KB)
--------AutoSeg_Parameters.txt(4KB)
----fdt_probtrackx2.py(7KB)
----dti_pipeline.py(12KB)
----connectome.py(5KB)
----fdt_masks.py(11KB)
----README.md(5KB)
----dti_pipeline_mp.py(13KB)
----pipeline_img.png(91KB)
----example_config()
--------config_pipeline_flags.txt(87B)
--------subjects.txt(27B)
--------config_pipeline.txt(284B)
----dwi_to_dti.py(6KB)
----fdt_bedpost.py(5KB)
----atlas_registration.py(6KB)