文件名称：clustifyr:使用大量RNA-seq或基因集推断scRNA-seq数据中的细胞类型
文件大小：2.82MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-28 07:31:13
rna-seq clusters marker-genes single-cell-rna-seq assign-identities
集群化器 clustifyr使用参考大量RNA-seq数据集，分类的微阵列表达数据，单细胞基因签名或标记基因列表对单细胞RNA测序实验中的细胞和簇进行分类。 如果不了解基础生物学，则难以注释单细胞转录组。 即使掌握了这些知识，由于缺乏常见标记基因的可检测表达，准确鉴定仍然具有挑战性。 clustifyr通过使用单细胞RNA序列，大量RNA序列数据，微阵列或标记基因列表自动注释单个细胞或细胞簇来解决此问题。 附加功能可对单细胞RNA-seq数据集和参考数据之间的相似性进行探索性分析。 安装 使用以下方法安装Bioconductor版本： if ( ! requireNamespace( " BiocManager " , quietly = TRUE )) install.packages( " BiocManager " ) BiocManager :: install( "