MATLAB典型环节代码-Leung_et_al_nature_2019:Leung等人的支持代码,2019年(自然)

时间:2024-06-12 04:30:51
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文件名称:MATLAB典型环节代码-Leung_et_al_nature_2019:Leung等人的支持代码,2019年(自然)

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更新时间:2024-06-12 04:30:51

系统开源

MATLAB典型代码代码和分析指南 欢迎使用本文的代码存储库和用户指南(Leung等人,2019)。 标题:斑马鱼睡眠的神经特征。 作者:路易·梁·梁·戈登·王,罗曼·马德琳,双子星·斯卡里亚,川一浩一,卡尔·戴瑟罗,亚历山大·E·厄本和菲利普·莫兰。 随附的论文在这里发布: 关联: DOI: 许可证:开源MIT许可证。 请注意:以下代码仅经过验证才能在带有MatLab的Windows 7计算机(v2013b和2016b,Mathworks)上运行。 Ca2 +成像 背侧颅骨(DP)成像 可以使用Matlab(MathWorks)分别使用singleChannelCaGUI.m或doubleChannelCaGUI.m处理1或2通道DP成像,然后使用plotCaImaging.m(可选)进行绘图。 设置路径-添加“ fPSG”和“下载”文件夹。 单通道GCaMP成像 singleChannelCaGUI() 选择具有数字顺序(.tifs)的GCaMP图像的文件夹。 选择是否要进行运动校正(可选),或者确保在名为“ motionCorrected”的文件夹中提供经过运动校正的图像(Fij


【文件预览】:
Leung_et_al_nature_2019-master
----LICENSE(1KB)
----fPSG()
--------deflicker.m(3KB)
--------plotECG.m(3KB)
--------polygeom.m(3KB)
--------sortdFF.m(2KB)
--------plotCaImaging.m(24KB)
--------rasterplot_LL.m(2KB)
--------singleChannelCaGUI.m(9KB)
--------uigetdir2.m(3KB)
--------menu.m(13KB)
--------tifftoepsConversion.m(400B)
--------absmax.m(1KB)
--------prepareMaskArrayRegion.m(4KB)
--------prepareMaskArrayRing.m(4KB)
--------doubleChannelCaGUI.m(10KB)
--------gain_slider.fig(1KB)
--------absmin.m(1KB)
--------drawRegionFree.m(4KB)
--------findimgs.m(1KB)
--------gain_slider.m(6KB)
----README.org(10KB)
----Downloads()
--------horizontal error bars()
--------FastICA_2.5()
--------shadedErrorBar()
--------Export_Fig()
--------motion_correction()
----Actimetry()
--------viewpointMovieFullOneMovie.m(9KB)
--------ViewpointFigMode4.m(33KB)
--------avitomp4Convert.m(775B)
--------wellMatrix.m(4KB)
--------ViewpointFigMode2.m(19KB)
--------ViewpointFigMode3.m(37KB)
--------vpextract.m(11KB)
--------uigetfile2.m(2KB)
--------ViewpointFigMode1.m(11KB)
--------ViewpointFigModeSingle.m(7KB)
--------mp4toaviConvert.m(1KB)
----Fiji()
--------addIntroFrames.ijm(1KB)
--------makeAnnotatedMovies.ijm(583B)
----Arduino()
--------Wake_Maintenance.ino(732B)

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