【文件属性】：
文件名称：MATLAB典型环节代码-Leung_et_al_nature_2019:Leung等人的支持代码，2019年（自然）
文件大小：171KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-23 10:44:11
系统开源
MATLAB典型代码代码和分析指南
欢迎使用本文的代码存储库和用户指南（Leung等人，2019）。
标题：斑马鱼睡眠的神经特征。
作者：路易·梁·梁·戈登·王，罗曼·马德琳，双子星·斯卡里亚，川一浩一，卡尔·戴瑟罗，亚历山大·E·厄本和菲利普·莫兰。
随附的论文在这里发布：
关联：
DOI：
许可证：开源MIT许可证。
请注意：以下代码仅经过验证才能在带有MatLab的Windows
7计算机（v2013b和2016b，Mathworks）上运行。
Ca2
+成像
背侧颅骨（DP）成像
可以使用Matlab（MathWorks）分别使用singleChannelCaGUI.m或doubleChannelCaGUI.m处理1或2通道DP成像，然后使用plotCaImaging.m（可选）进行绘图。
设置路径-添加“
fPSG”和“下载”文件夹。
单通道GCaMP成像
singleChannelCaGUI()
选择具有数字顺序（.tifs）的GCaMP图像的文件夹。
选择是否要进行运动校正（可选），或者确保在名为“
motionCorrected”的文件夹中提供经过运动校正的图像（Fij
【文件预览】：
Leung_et_al_nature_2019-master
----LICENSE(1KB)
----fPSG()
--------deflicker.m(3KB)
--------plotECG.m(3KB)
--------polygeom.m(3KB)
--------sortdFF.m(2KB)
--------plotCaImaging.m(24KB)
--------rasterplot_LL.m(2KB)
--------singleChannelCaGUI.m(9KB)
--------uigetdir2.m(3KB)
--------menu.m(13KB)
--------tifftoepsConversion.m(400B)
--------absmax.m(1KB)
--------prepareMaskArrayRegion.m(4KB)
--------prepareMaskArrayRing.m(4KB)
--------doubleChannelCaGUI.m(10KB)
--------gain_slider.fig(1KB)
--------absmin.m(1KB)
--------drawRegionFree.m(4KB)
--------findimgs.m(1KB)
--------gain_slider.m(6KB)
----README.org(10KB)
----Downloads()
--------horizontal error bars()
--------FastICA_2.5()
--------shadedErrorBar()
--------Export_Fig()
--------motion_correction()
----Actimetry()
--------viewpointMovieFullOneMovie.m(9KB)
--------ViewpointFigMode4.m(33KB)
--------avitomp4Convert.m(775B)
--------wellMatrix.m(4KB)
--------ViewpointFigMode2.m(19KB)
--------ViewpointFigMode3.m(37KB)
--------vpextract.m(11KB)
--------uigetfile2.m(2KB)
--------ViewpointFigMode1.m(11KB)
--------ViewpointFigModeSingle.m(7KB)
--------mp4toaviConvert.m(1KB)
----Fiji()
--------addIntroFrames.ijm(1KB)
--------makeAnnotatedMovies.ijm(583B)
----Arduino()
--------Wake_Maintenance.ino(732B)