文件名称：SIMER:生命科学与育种的数据模拟
文件大小：3.17MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-18 09:03:24
R
西蒙 生命科学与育种的数据模拟 作者： 设计和维护， ，，，和。 撰稿人：唐振双，徐静亚，李新云，朱梦津，袁晓慧和赵树红 欢迎提出问题，建议和错误报告： 内容 安装 我们强烈建议在Microsoft R Open上安装SIMER（ ） 安装 # the the development version from GitHub: # install.packages("devtools") devtools :: install_github( " xiaolei-lab/SIMER " ) 成功安装后，可以通过键入以下内容加载SIMER > library( simer ) 键入?simer可以获取所有参数的详细信息。 资料准备 基因型 基因型数据应为数字（m行和（2 * n）列，m为SNP数，n为个体数）格式。 如果你在PLINK二进制格式的基因型数据（详见 ），VCF或单体型
【文件预览】：
SIMER-master
----SIMER.Rproj(399B)
----NAMESPACE(1KB)
----DESCRIPTION(2KB)
----inst()
--------extdata()
----R()
--------genotype.r(12KB)
--------reproduces.r(25KB)
--------simer.Logging.R(1KB)
--------breeding.R(18KB)
--------phenotype.r(46KB)
--------simdata.R(1KB)
--------zzz.R(863B)
--------simer.Utility.R(27KB)
--------simer.r(87KB)
--------selects.r(22KB)
----.Rbuildignore(39B)
----LICENSE(11KB)
----README.md(96KB)
----data()
--------datalist(34B)
--------simdata.rda(3.16MB)
----man()
--------reproduces.Rd(2KB)
--------getindex.Rd(620B)
--------getfam.Rd(742B)
--------cal.r.Rd(1KB)
--------selects.Rd(4KB)
--------mate.Rd(889B)
--------cal.multi.Rd(3KB)
--------set.pheno.Rd(2KB)
--------mate.randmate.Rd(1KB)
--------getsd.Rd(720B)
--------build.CV.Rd(606B)
--------cal.gnt.Rd(2KB)
--------remove_bigmatrix.Rd(856B)
--------simer.sample.Rd(796B)
--------cal.FR.Rd(2KB)
--------build.cov.Rd(898B)
--------mate.clone.Rd(1KB)
--------write.file.Rd(3KB)
--------mate.dh.Rd(1KB)
--------genotype.Rd(2KB)
--------input.geno.Rd(830B)
--------mate.selfpol.Rd(1KB)
--------format_time.Rd(278B)
--------simer.Rd(9KB)
--------simer.print.Rd(657B)
--------sel.idx.Rd(755B)
--------getgmt.Rd(553B)
--------cal.idx.Rd(2KB)
--------userped.Rd(339B)
--------cal.eff.Rd(1KB)
--------paste_label.Rd(458B)
--------phenotype.Rd(5KB)
--------print_info.Rd(2KB)
--------generate.map.Rd(570B)
--------mate.randexself.Rd(1KB)
--------num2num.Rd(401B)
--------sel.core.Rd(2KB)
--------make_line.Rd(338B)
--------cal.pheno.Rd(2KB)
--------rule_wrap.Rd(397B)
--------simer.show.file.Rd(612B)
--------geno.cvt1.Rd(595B)
--------mate.singcro.Rd(2KB)
--------geno.cvt2.Rd(522B)
--------cal.blk.Rd(650B)
--------complan.Rd(4KB)
--------simer.Version.Rd(495B)
--------getpop.Rd(642B)
--------cal.sing.Rd(2KB)
--------print_bar.Rd(924B)
--------cal.effs.Rd(4KB)
--------input.map.Rd(345B)
--------A.cal.Rd(501B)
--------check.map.Rd(788B)
--------rawgeno.Rd(365B)
----.gitignore(74B)