2020-ncov:的伴随代码

时间:2024-03-28 12:12:36
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文件名称:2020-ncov:的伴随代码

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更新时间:2024-03-28 12:12:36

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2020年 对2019/20年期间2019-nCoV爆发的分析。 注意:这是有效的存储库,因此代码和数据可能会随时间而变化 stoch_model文件指南 这是使用Euler-Maruyama实现的随机SEIR模型,并通过SMC通过拟合武汉市的案例和随时间推移到武汉连接性较高的国家/地区的出口案例共同估算了可能性。 数据加载和模型运行脚本位于scripts/main_model.r 。 调用以下R文件: R/load_timeseries.r加载和格式化时间序列 R/model_functions.r加载过程模型和SMC R/plotting_functions.r绘图功能 outputs_main.R运行主模型输出 可以在stoch_model_V1_paper找到V1所用的代码和数据,其路径与上述相同。 我们最终的《柳叶刀传染病》论文所使用的代码和数据可在stoch_model


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