文件名称：matlab复制代码后不能运行-PAVE:铺平
文件大小：4.28MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 08:11:40
系统开源
matlab复制代码后不能运行PAVE（父离子注释和验证引擎）是一组matlab代码，用于使用13C和15N同位素标记从LC-MS数据中识别非目标代谢物。 有关使用PAVE和运行示例的说明（要求：Matlab 2015a或更高版本）： 下载或克隆整个存储库。 （注意：由于文件大的限制，此处不包括示例LC-MS数据，请参阅步骤2） 请点击下面的链接下载LC-MS数据文件并将其保存在文件夹“ \ example”中。有两个大文件：“ M_neg_yeast.mat”和“ M_CID_neg_yeast.mat”，它们是使用.mzXML文件从原始文件生成的。 \ tools \ parse_neg.m中的代码，并且是运行PAVE示例所必需的。 还有一个名为“ raw”的文件夹，其中包含用于生成上述两个文件的所有原始.mzXML文件。 转到文件夹“ \ example”并运行PAVE_ini。 这将初始化设置并加载所需的数据和配置。 （有关详细信息，请参见PAVE工作流程文档。）有两个文件：“ Peaklist_yeast_neg.csv”和“ CID_neg_yeast.csv”，这些文件是
【文件预览】：
PAVE-master
----PAVE workflow documentation.docx(18KB)
----pave_identify_frag.m(2KB)
----pave_junkremover.m(266B)
----pave_find_adduct.m(2KB)
----pave_atomcount.m(3KB)
----pattern_finder.m(312B)
----example()
--------PAVE_ini.m(2KB)
--------Peaklist-yeast-neg.csv(1.57MB)
--------CID-neg-yeast.csv(4MB)
----LICENSE(1KB)
----tools()
--------mzxml2struct.m(624B)
--------covert_to_mydb.m(704B)
--------mzxmlread_xi.m(33KB)
--------parse_pos_1_2.m(2KB)
--------parse_neg.m(653B)
--------formula2mass.m(8KB)
--------parse_pos_combine.m(1KB)
----pave_find_dup.m(480B)
----pave_dbsearch.m(1KB)
----README.md(3KB)
----PAVE_main_single.m(378B)
----adduct_list_config.xlsx(10KB)
----atomcount_disp.m(1KB)
----EIC.m(2KB)
----pattern.m(532B)
----PVAE_output.m(558B)
----boundary99.mat(629B)
----PAVE_main.m(1KB)
----pave_find_lowC.m(559B)
----PAVE_stat.m(321B)
----pave_find_dimer.m(1KB)
----inlist.m(409B)
----db_master.xlsx(2.07MB)