DNA-Sequencing-Boyer-Moore-Approximate-Matching:用Python编码的几种DNA测序算法

时间:2024-05-21 11:02:44
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文件名称:DNA-Sequencing-Boyer-Moore-Approximate-Matching:用Python编码的几种DNA测序算法

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更新时间:2024-05-21 11:02:44

Python

具有近似匹配的DNA测序算法:Boyer-Moore,K-Mer指数,Pigeon-Hole。 Python编码了几种DNA测序算法: 通用天真近似匹配最多允许n个不匹配 具有近似匹配的Boyer-Moore预处理 博伊尔·摩尔(Boyer-Moore)的鸽子洞和近似匹配 带有K-Mer指数和近似匹配的鸽子洞


【文件预览】:
DNA-Sequencing-Boyer-Moore-Approximate-Matching-master
----chr1.GRCh38.excerpt.fasta(791KB)
----boyermoore.py(12KB)
----pigeonhole.py(5KB)
----naive_2mm.py(5KB)
----README.md(388B)
----__pycache__()
--------boyermoore.cpython-34.pyc(11KB)

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