obographviz:将OBO图转换为dotgraphviz

时间:2024-05-21 04:50:50
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文件名称:obographviz:将OBO图转换为dotgraphviz

文件大小:16.49MB

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更新时间:2024-05-21 04:50:50

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将OBO图转换成Dot / Graphviz 输入:一个对象 可选:JSON本体样式表 输出:点格式/ Graphviz文件 快速开始 命令行: ./bin/og2dot.js tests/simple-og.json > test.dot dot test.dot -Tpng -Grankdir=BT > test.png 命令行; 来自 ogr -p subClassOf BFO:0000050 -r obo:go -t png g nucleus API: var compoundRelations = ['BFO:0000050'] var styleMap = {} var gv = new ogv.OboGraphViz(result.data) var dot = gv.renderDot(compoundRelations, styleMap) 特征 套料 一个或多个


【文件预览】:
obographviz-master
----.travis.yml(217B)
----bin()
--------og2dot.js(3KB)
----index.js(118B)
----package.json(1KB)
----schema()
--------style-schema.json(10KB)
----gulpfile.js(3KB)
----tests()
--------equiv.test.js(527B)
--------equivs.json(2KB)
--------lego-example.json(112KB)
--------viz.test.js(2KB)
--------equivs.obo(457B)
--------simple-og.json(2KB)
--------nest.json(3KB)
--------biogrid-dipper-example.json(62KB)
--------so-example.json(11KB)
----package-lock.json(206KB)
----examples()
--------uberon-zfa-xref-example.png(476KB)
--------digit.png(1.31MB)
--------uberon-style.json(1KB)
--------so-example.pdf(21KB)
--------onts()
--------uberon-zfa-xref-example.json(124KB)
--------uberon-ancs-UBERON_0011591.owl.old(13.69MB)
--------uberon-ancs-UBERON_0011591.owl(13.69MB)
--------so-example.dot(4KB)
--------uberon-zfa-style.json(2KB)
--------digit.json(261KB)
--------nested-example.png(16KB)
--------so-example.png(76KB)
--------lego-example2.pdf(18KB)
--------RDF-Cache()
--------example-style.json(290B)
--------Makefile(443B)
--------uberon-ancs-UBERON_0011591.json(5.49MB)
--------gocam-style.json(2KB)
--------lego-example2.png(114KB)
----.gitignore(50B)
----foo.png(10KB)
----lib()
--------obographviz.js(20KB)
--------index.js(111B)
--------cliqueIndex.js(2KB)
----Makefile(67B)
----README.md(6KB)

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