savvy:与各种变体调用格式的接口

【文件属性】：

文件名称：savvy:与各种变体调用格式的接口

文件大小：273KB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-04-10 23:57:00

C++

此存储库中的所有分支都是开发分支。最新的稳定版本可以在部分中找到。 精明的图书馆 Savvy是的官方C ++接口，并提供对BCF和VCF文件的无缝支持。 自版本2.0发布以来，Savvy不再支持写入SAV 1.x文件，但将继续支持读取现有1.x文件。 正在安装 安装Savvy及其依赖项的最简单方法是使用 。 cget install --prefix < install> statgen/savvy # default is ./cget/ 包括在项目中 CMakeLists.txt： # Configure with cmake option: -DCMAKE_TOOLCHAIN_FILE=/cget/cget.cmake find_package (savvy REQUIRED ) add_execu

【文件预览】：
savvy-master
----dep()
--------htslib.cmake(2KB)
----s1r_spec.md(4KB)
----packaging-dockerfile-ubuntu16(210B)
----.github()
--------workflows()
----s1r_diagram.png(39KB)
----include()
--------test()
--------sav()
--------savvy()
----m3vcf_spec.md(3KB)
----LICENSE(16KB)
----Doxyfile(112KB)
----sav_spec_v2.md(6KB)
----src()
--------eval()
--------test()
--------sav()
--------savvy()
----requirements.txt(62B)
----doc()
--------variant_group_iterator.md(2KB)
--------genotype_matrix.md(3KB)
----.gitignore(266B)
----CMakeLists.txt(8KB)
----package-linux.sh(2KB)
----test_file.vcf(5KB)
----sav_spec.md(3KB)
----README.md(6KB)
----scripts()
--------compare-gt-compression.sh(1KB)