【文件属性】:
文件名称:matlab图像对比度扩展代码-GAMBA-MATLAB:GAMBA-MATLAB
文件大小:28KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-24 06:40:37
系统开源
matlab图像尺寸扩展代码GAMBA-MATLAB
一个MATLAB工具箱,用于研究目标基因(GOI)和神经影像来源的脑表型的表达是否显示出重叠的空间模式。
不同的统计无效模型可用于检查基因特异性和空间特异性。
该工具箱是Web应用程序的扩展。
有关详细信息,请参阅:
魏Y等。
(2021),基因转录组-神经影像关联的统计测试和注释,bioRxiv
安装
要求
在开始之前,请确保您的机器上装有MATLAB
。
在我们的示例中,我们用于执行图像配准。
您可以将其他等效的工具用于相同的目的。
有关详细信息,请参见example.m
。
下载
通过终端中的命令行:
git
clone
https://github.com/dutchconnectomelab/GAMBA-MATLAB.git
。
或者,您可以单击“代码-下载ZIP”并解压缩下载的文件。
添加到路径
打开MATLAB,单击“设置路径”-“使用子文件夹添加...”,然后将GAMBA-MATLAB文件夹添加到搜索路径。
然后点击“保存”。
提取所需数据
在MATLAB中运行install.m以检索所有必需的数据。
或者,您可以在
【文件预览】:
GAMBA-MATLAB-main
----.gitignore(111B)
----README.md(13KB)
----LICENSE(1KB)
----examples.m(6KB)
----src()
--------permutation_expression_null_brain.m(4KB)
--------permutation_expression_null_coexp.m(4KB)
--------y_rand_gs_coexp.m(4KB)
--------permutation_null_brain.m(5KB)
--------permutation_null_coexp.m(5KB)
--------group_regions.m(2KB)
--------permutation_null_spin.m(5KB)
--------permutation_expression_null_spin.m(4KB)
--------permutation_null_spin_correlated_genes.m(3KB)
--------freesurfer()
----install.m(2KB)