mdgrad:pytorch可微分的分子动力学

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文件名称：mdgrad:pytorch可微分的分子动力学
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更新时间：2021-05-19 19:40:47
polymer chemistry molecular-dynamics statistical-mechanics physics-simulation 火炬手 这不仅是一个普通的模拟器，而且是一个可区分的模拟器！ 用于端到端可区分分子模拟的PyTorch代码。 将会有更多的文档和教程。 此仓库正在大力开发中，非常欢迎您的贡献。 强调 通过ODE解算器（O（1）反向传播）进行反向模式自动微分 支持的求解器：四阶Runge-Kutta和Velocity Verlet 包括一个图形神经网络模块（我们自己的SchNet实现） GPU加速邻居列表算法 实现了端到端的可观察性-RDF，VACF 适用于单分子和凝聚相（液体和固体） 与ASE兼容以进行系统初始化 用户可以将界面编写到他们最喜欢的Force Field架构（SchNet，DimeNet，SE3NN，LAMMPS等） Wang，W.，Axelrod，S.，＆Gómez-Bombarelli，R.（2020年）。 用于控制和学习的微分分子模拟。 此仓库具有以下： 聚合物的差异