参考：linuxdot.net
其实jexus的配置还是比较简单的，目录即站点（一个目录就是一个站点，一个配置文件就是一个站点）
如uustudy.net，在siteconf目录下创建一个uustudy.net为名称的文件，这就是一个站点，
另外创建一个alinmi.com名称的文件，这是另外一个站点。
如下图所示：
上面是我自己的配置方式，下面是用比较通用话的方式配置。
网站的配置文件都放在jexus的安装目录下
比如：
/usr/jexus/siteconf/site1
/usr/jexus/siteconf/site2
/usr/jexus/siteconf/site3
#site1 config
#端口号
port=80
#网站所在目录
root=/ /home/www/site1
#访问该站点所用的域名
hosts=site1.com,www.site1.com
#是否使用压缩
usegzip=true
usephp=true
#默认主页
indexs=index.php
fastcgi.add=php|socket:/var/run/jexus/phpsvr
site2以此类推，上面是php的，根据自己情况配置
需要注意的地方：无论你创建了多少个站点，想要域名直接访问各自的站点，每个网站的配置文件的Port都是80，这样才可以直接域名访问而不用加端口。