/ - 根目录
每一个文件和目录都从根目录开始。
只有root用户具有该目录下的写权限。请注意，/root是root用户的主目录，这与/不一样
根目录是整个系统最重要的一个目录，因为不但所有的目录都是由根目录衍生出来的， 同时根目录也与开机/还原/系统修复等动作有关。 由于系统开机时需要特定的开机软件、核心文件、开机所需程序、 函式库等等文件数据，若系统出现错误时，根目录也必须要包含有能够修复文件系统的程序才行。 因为根目录是这么的重要，所以在FHS的要求方面，他希望根目录不要放在非常大的分区， 因为越大的分区内你会放入越多的数据，如此一来根目录所在分区就可能会有较多发生错误的机会。
因此FHS标准建议：根目录(/)所在分区应该越小越好， 且应用程序所安装的软件最好不要与根目录放在同一个分区内，保持根目录越小越好。 如此不但效能较佳，根目录所在的文件系统也较不容易发生问题。说白了，就是根目录和Windows的C盘一个样。
/bin - 用户二进制可执行文件
系统的所有用户使用的命令都设在这里，如ps、ls、ping、grep、cp等
/sbin目录 - 系统二进制文件
就像/bin，/sbin同样也包含二进制可执行文件。
但是，在这个目录下的linux命令通常由系统管理员使用，对系统进行维护。例如：iptables、reboot、fdisk、ifconfig、swapon命令
/etc - 配置文件
包含所有程序所需的配置文件。
也包含了用于启动/停止单个程序的启动和关闭shell脚本。例如：/etc/resolv.conf、/etc/logrotate.conf
/dev - 设备文件
包含设备文件。
这些包括终端设备、USB或连接到系统的任何设备。例如：/dev/tty1、/dev/usbmon0
/proc - 进程信息
包含系统进程的相关信息。
这是一个虚拟的文件系统，包含有关正在运行的进程的信息。例如：/proc/{pid}目录中包含的与特定pid相关的信息。
这是一个虚拟的文件系统，系统资源以文本信息形式存在。例如：/proc/uptime
/var - 变量文件
var代表变量文件。
这个目录下可以找到内容可能增长的文件。
这包括 - 系统日志文件（/var/log）;包和数据库文件（/var/lib）;电子邮件（/var/mail）;打印队列（/var/spool）;锁文件（/var/lock）;多次重新启动需要的临时文件（/var/tmp）;
/tmp - 临时文件
包含系统和用户创建的临时文件。
当系统重新启动时，这个目录下的文件都将被删除。
/usr - 用户程序
不是user的缩写，其实usr是Unix Software Resource的缩写
包含二进制文件、库文件、文档和二级程序的源代码。
/usr/bin/
绝大部分的用户可使用指令都放在这里。请注意到他与/bin的不同之处。(是否与开机过程有关)
/usr/include/
c/c++等程序语言的档头(header)与包含档(include)放置处，当我们以tarball方式 (*.tar.gz 的方式安装软件)安装某些数据时，会使用到里头的许多包含档。
/usr/lib/
包含各应用软件的函式库、目标文件(object file)，以及不被一般使用者惯用的执行档或脚本(script)。 某些软件会提供一些特殊的指令来进行服务器的设定，这些指令也不会经常被系统管理员操作， 那就会被摆放到这个目录下啦。要注意的是，如果你使用的是X86_64的Linux系统， 那可能会有/usr/lib64/目录产生
/usr/local/
统管理员在本机自行安装自己下载的软件(非distribution默认提供者)，建议安装到此目录， 这样会比较便于管理。举例来说，你的distribution提供的软件较旧，你想安装较新的软件但又不想移除旧版， 此时你可以将新版软件安装于/usr/local/目录下，可与原先的旧版软件有分别啦。 你可以自行到/usr/local去看看，该目录下也是具有bin, etc, include, lib…的次目录
/usr/sbin/
非系统正常运作所需要的系统指令。最常见的就是某些网络服务器软件的服务指令(daemon)
/usr/share/
放置共享文件的地方，在这个目录下放置的数据几乎是不分硬件架构均可读取的数据， 因为几乎都是文本文件嘛。在此目录下常见的还有这些次目录：/usr/share/man：联机帮助文件
/usr/share/doc：软件杂项的文件说明
/usr/share/zoneinfo：与时区有关的时区文件
/usr/src/
一般原始码建议放置到这里，src有source的意思。至于核心原始码则建议放置到/usr/src/linux/目录下。
/home - HOME目录
所有用户用home目录来存储他们的个人档案。
例如：/home/john、/home/nikita
/boot - 引导加载程序文件
包含引导加载程序相关的文件。
内核的initrd、vmlinux、grub文件位于/boot下。
例如：initrd.img-2.6.32-24-generic、vmlinuz-2.6.32-24-generic
/lib - 系统库
包含支持位于/bin和/sbin下的二进制文件的库文件.
库文件名为 ld*或lib*.so.*
例如：ld-2.11.1.so，libncurses.so.5.7
/opt - 可选的附加应用程序
opt代表可选的。
包含从个别厂商的附加应用程序。
附加应用程序应该安装在/opt/或者/opt/的子目录下。
/mnt - 挂载目录
临时安装目录，系统管理员可以挂载文件系统。
/media - 可移动媒体设备
用于挂载可移动设备的临时目录。
举例来说，挂载CD-ROM的/media/cdrom，挂载软盘驱动器的/media/floppy;
/srv - 服务数据
srv代表服务。
包含服务器特定服务相关的数据。
例如，/srv/cvs包含cvs相关的数据。