1. 定义
JRE(Java Runtime Enviroment)是Java的运行环境。面向Java程序的使用者，而不是开发者。如果你仅下载并安装了JRE，那么你的系统只能运行Java程序。JRE是运行Java程序所必须环境的集合，包含JVM标准实现及 Java核心类库。它包括Java虚拟机、Java平台核心类和支持文件。它不包含开发工具(编译器、调试器等)。
JDK(Java Development Kit)又称J2SDK(Java2 Software Development Kit)，是Java开发工具包，它提供了Java的开发环境(提供了编译器javac等工具，用于将java文件编译为class文件)和运行环境(提 供了JVM和Runtime辅助包，用于解析class文件使其得到运行)。如果你下载并安装了JDK，那么你不仅可以开发Java程序，也同时拥有了运行Java程序的平台。JDK是整个Java的核心，包括了Java运行环境(JRE)，一堆Java工具tools.jar和Java标准类库 (rt.jar)。
JVM(Java Virtual Mechinal(JAVA虚拟机)。JVM是JRE的一部分，它是一个虚构出来的计算机，是通过在实际的计算机上仿真模拟各种计算机功能来实现的。JVM有自己完善的硬件架构，如处理器、堆栈、寄存器等，还具有相应的指令系统。JVM 的主要工作是解释自己的指令集（即字节码）并映射到本地的 CPU 的指令集或 OS 的系统调用。Java语言是跨平台运行的，其实就是不同的操作系统，使用不同的JVM映射规则，让其与操作系统无关，完成了跨平台性。JVM 对上层的 Java 源文件是不关心的，它关注的只是由源文件生成的类文件（ class file）。类文件的组成包括 JVM 指令集，符号表以及一些补助信息。
我们开发的实际情况是：我们利用JDK（调用JAVA API）开发了属于我们自己的JAVA程序后，通过JDK中的编译程序（javac）将我们的文本java文件编译成JAVA字节码，在JRE上运行这些JAVA字节码，JVM解析这些字节码，映射到CPU指令集或OS的系统调用。
2. 区别
JRE主要包含：java类库的class文件(都在lib目录下打包成了jar)和虚拟机(jvm.dll)；JDK主要包含：java类库的 class文件(都在lib目录下打包成了jar)并自带一个JRE。那么为什么JDK要自带一个JRE呢？而且jdk/jre/bin下的client 和server两个文件夹下都包含jvm.dll(说明JDK自带的JRE有两个虚拟机)。
记得在环境变量path中设置jdk/bin路径吗？老师会告诉大家不设置的话javac和java是用不了的。确实jdk/bin目录下包含了所有的命令。可是有没有人想过我们用的java命令并不是jdk/bin目录下的而是jre/bin目录下的呢？不信可以做一个实验，大家可以把jdk /bin目录下的java.exe剪切到别的地方再运行java程序，发现了什么？一切OK！(JRE中没有javac命令，原因很简单，它不是开发环境)那么有人会问了？我明明没有设置jre/bin目录到环境变量中啊？试想一下如果java为了提供给大多数人使用，他们是不需要jdk做开发的，只需要jre能让java程序跑起来就可以了，那么每个客户还需要手动去设置环境变量多麻烦啊？所以安装jre的时候安装程序自动帮你把jre的java.exe添加到了系统变量中，验证的方法很简单，去Windows/system32下面去看看吧，发现了什么？有一个java.exe。
3. 难点和疑惑
如果安装了JDK，会发现你的电脑有两套JRE，一套位于C:\Program Files\Java\jre6， 另外一套位于 C:\ProgramFiles\Java\jdk1.6.0_41\jre目录下。
JRE的地位就象一台PC机一样，我们写好的Win32应用程序需要操作系统帮我们运行，同样的，我们编写的Java程序也必须要JRE才能运行。所以当你装完JDK后，如果分别在硬盘上的两个不同地方安装了两套JRE，那么你可以想象你的电脑有两台虚拟的Java PC机，都具有运行Java程序的功能。所以我们可以说，只要你的电脑安装了JRE，就可以正确运行Java应用程序。
a.为什么Sun要让JDK安装两套相同的JRE？
这是因为JDK里面有很多用Java所编写的开发工具，如javac.exe、jar.exe等，这些命令放置在 C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_41\bin目录里。
因为他们是java编写的命令，所以要依靠java的jar包，这些jar包存放在C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_41\lib目录里。如果将C:\ProgramFiles\Java\jdk1.6.0_41\lib\目录里面的tools.jar改名为tools1.jar，然后运行javac.exe，显示如下结果：
Exception in thread "main"java.lang.NoClassDefFoundError: com/sun/tools/javac /Main
但是输入 java -cp C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_41\lib\tools1.jarcom.sun.tools.javac.Main
会得到与javac.exe相同的结果。从这里我们可以证明javac.exe只是一个包装器（Wrapper），而制作的目的是为了让开发者免于输入太长的指命。而且我们可以发现C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_41\bin目录下的程序都很小，不大于29K，从这里我们可以得出一个结论。就是JDK里的工具几乎是用Java所编写，所以也是Java应用程序，因此要使用JDK所附的工具来开发Java程序，也必须要自行附一套JRE才行，所以位于C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_41\jre目录下的那套JRE就是用来运行一般Java程序用的。
b.如果一台电脑安装两套以上的JRE，谁来决定呢？
这个重大任务就落在java.exe身上。java.exe的工作就是找到合适的JRE来运行Java程序。 java.exe依照底下的顺序来查找JRE：自己的目录下有没有JRE；父目录有没有JRE；查询注册表： [HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\JavaSoft\Java Runtime Environment] 。所以java.exe的运行结果与你的电脑里面哪个JRE被执行有很大的关系。