R中单细胞RNA-seq分析教程 (5)-11. 结果保存

时间:2024-12-17 07:10:17

这就是本教程第一部分的全部内容,涵盖了对单个 scRNA-seq 数据集进行的大部分基础分析。在分析结束时,当然希望保存结果,可能是操作过一段时间的 Seurat 对象,这样下次就不需要重新运行所有分析了。保存 Seurat 对象的方法与保存其他 R 对象一样。可以使用 saveRDS/readRDS 来分别保存和加载 Seurat 对象。

saveRDS(seurat, file="DS1/seurat_obj_all.rds")
saveRDS(seurat_dorsal, file="DS1/seurat_obj_dorsal.rds")

seurat <- readRDS("DS1/seurat_obj_all.rds")
seurat_dorsal <- readRDS("DS1/seurat_obj_dorsal.rds")

或者可以使用 save/load 来一起保存或加载多个对象。

save(seurat, seurat_dorsal, file="DS1/seurat_objs.rdata")
load("DS1/seurat_objs.rdata")

未完待续,欢迎关注!

动动您发财的小手点个赞吧!欢迎转发!

Reference
[1]

Source: https://github.com/quadbio/scRNAseq_analysis_vignette