要进行Java Web开发，肯定需要一款比较好的IDE，我这里使用的Eclipse neon。
一、新建Dynamic Web Project
（一）使用Eclipse新建
如果下载的不是Eclipse 的Java EE IDE版本，那是不能直接创建Dynamic Web Project的，需要手动安装Web插件，安装过程见我的另一篇文章：
Eclipse 安装插件开发Java EE：http://blog.csdn.net/yc_wj/article/details/69223160
新建Dynamic Web Project 还需要把 Tomcat 整合到Eclipse中，这样便于我们使用。整合方式见：
Eclipse 配置Tomcat，更改web项目默认部署路径：http://blog.csdn.net/yc_wj/article/details/69229340
在配置Tomcat时，如果发现 Eclipse的 Windows --> Preferences --> Server下没有Tomcat选项，那就需要安装JST Server Adapters Extensons插件，直接进市场搜索即可。
上面的工作完成了，就可以开始开发Web项目了。
1、选择 File --> New --> Dynamic Web Project 即可新建一个Java Web项目，如果 New 子菜单下没有 Dynamic Web Project 选项，那就点击最下方的 Other... 选项
在弹出来的窗口中搜索 Dynamic，就会出现 Dynamic Web Project 选项，如下图：
2、选择Dynamic Web Project 后，会弹出窗口让你填写项目相关信息
1是项目名称，2是项目文件所在路径，默认是Eclipse的工作空间。3是使用的服务器，前面如果配置好了服务器，这里会自动填好，如果没有配置，也可以点击后面的New RunTime按钮进行配置。
3、填写好相关信息后，点击下方 Next> 按钮（不要直接敲回车键，因为敲回车默认敲在 Finish 按钮上了，会直接结束导致一些配置不全，虽然后面可以修改，但还是Next，这样配置比较直观易懂），弹出如下窗口：
这里要记得修改Defalut output folder，这个是源文件的默认编译后输出的位置，也就是.class文件的位置。如果不修改，就会放在 ProjectName/build/classes 目录下。但在Web应用中，这些 .class 文件应该放在 ProjectName/WebContent/WEB-INF/classes 目录下，这样服务器才能找到并加载运行。所以要将 build/classes 修改为 WebContent/WEB-INF/classes，然后点 击Next>,弹出如下窗口。
1是 Context root（项目根目录）默认就是项目名，2是 Content directory（项目内容目录）存放Web资源的目录，不同工具默认值不同，Eclipse是WebContent，不用修改。3一定要勾选上（表示创建通用的 web.xml 文件，这个文件是部署描述符，服务器运行项目必不可少的），虽然后面可以手动创建，但建议还是在这里勾选。
4、点击 Finish 后就可以在 Project Explorer 下看到创建的Web项目，如下图：
Eclipse 创建的Web项目目录如上，会自动生成四个目录：
Deployment Descriptor：TestEclipse 这个是关于项目的部署描述信息，也就是 web.xml 中的信息，不过这里分类列出来了。
Java Resources 这个目录下的 src 目录是用来存放Java 源文件的，例如 java类。而 Libraries 目录是个逻辑性的目录，表示项目引用的各种 JAR 包。
JavaScript Resources 存放的就是 JavaScript 资源
WebContent 这个目录是必要的，可以单独打包这个目录到部署到服务器就可以运行了，WebContent/WEB-INF目录存Web相关信息，可以看到 web.xml 文件就子在这个目录下，而 lib 目录则是存放项目所需 JAR 包的物理目录（就是说必须手动复制JAR到这个目录），其实这个 WebContent 目录下还有一个 classes 目录，不过在这个视图中看不到，需要在 Navigator 视图中查看。
怎么打开 Navigator 视图呢？
Window --> Show View 下就可以找到这个视图，需要打开其它视图也都在这个里面找就行了。
可以去项目存放的物理路径下查看，会发现只有src目录和WebContent目录，这也说明了其它目录实际上是逻辑上的目录，为了管理方便。
进过上面4步就可以成功的建立一个Dynamic Web Project了。
一般不用管 Deployment Descriptor：TestEclipse 和JavaScript Resources 这两个。但要好好了解下另外两个的作用，毕竟你开发Web项目，不能连结构都搞不清嘛。
（二）不适用Eclipse新建Web项目
直接在 Tomcat 服务器的 WebApps 目录下，新建一个项目Test，然后在 Test 目录下新建 WebContent，在 WebContent 目录下新建 WEB-INF，在WEB-INF目录下，新建一个lib文件和一个web.xml文件。
然后就好了，，，从这个过程也能看出，对于一个Java Web目录，最重要的就是 WebContent目录，然后WEB-INF目录，然后 lib 目录和 web.xml 文件。
关于Tomcat 服务器的各目录，也应该要好好了解，可参考博客：http://blog.csdn.net/jdjdndhj/article/details/52694202
Tomcat Server.xml配置文件解析：http://blog.csdn.net/itmagic_jack/article/details/6290239
Tomcat Web.xml配置文件解析：http://blog.csdn.net/itmagic_jack/article/details/6293042
二、使用WebContent目录
第一步中已经搭建起了Java Web项目所需要的目录结构，但这还只是个空架子。接下来就像里面添内容
很多资料上都是直接将 JSP文件放在 WebContent 目录下，但如果有很多JSP文件怎么办了，会显得目录很杂乱不好管理，又因为现在的 JSP文件都是作为视图层的，所以应该新建一个 View 目录存放JSP文件，即使是初学者也应该这样做，才能更好的学习MVC开发模式，这样只不过在访问时需要多加一层路径。
然后，项目总会有很多静态资源的，比如页面的CSS样式文件、JS文件、图片等。所以还应该在 WebContent 目录下新建一个 Public 目录，然后在 Public 目录下新建CSS、JS、Images等目录，分类存放各种资源，这样能更好的管理自己的项目。
这里就不介绍 JSP 要怎么编写了，你也可以直接建一个 html 页面作为测试。
三、部署项目到服务器并访问 （设置虚拟目录）
Eclipse 配置Tomcat，更改web项目默认部署路径：http://blog.csdn.net/yc_wj/article/details/69229340
在上面链接的文章中，已经提到来了怎么部署项目到服务器。所以这里就只说一下怎么设置 Tomcat 服务器的虚拟目录，网上有好几种方式，我这里只说一种最常用的。
PS：初学者还是应该尝试一下所有的部署方式，体会下不同，只有自己动手才能真正的理解和学习。
虚拟目录不同于原始的Tomcat运行方式，原始的方式是把项目拷贝到 webapps 下，然后启动 tomcat，就可以访问 webapps 下的项目。我们使用eclipse配置tomcat，实际上的原理也是这种方式。
但这种方式的弊端在于，webapps 下的项目不是最新的动态，一旦我们修改了eclipse工作目录下的项目，并不能立刻的反应到 tomcat/webapps 下。所以我们不得不编译项目后，清除 webapps 下的缓存，甚至要移除项目，然后再放进去。这样来回折腾，大大降低了工作效率。我们只要改动一个小地方，就要重复的进行一次上面的工作。而且初学的时候，很容易建立很多个项目作为测试，如果都直接部署在 webapps 下，就会导致服务器启动耗时很长，因为服务器会要读取所有项目的配置信息。
而且直接部署到服务器的话，相当于把项目从工作空间，物理的复制到了服务器的webapps目录下或者是你指定的其它物理位置，总之就相当于有两份相同的同时存在了。
总感觉这样很不爽，所以就有了通过虚拟目录的方法来部署项目了。
虚拟目录的作用是把 Web 的发布目录直接定位到 eclipse 工作目录下，实现实时更新，实时使用，也就不会有复制的过程了。下面介绍的方法不用修改Tomcat的server.xml
在 Tomcat 8.5\conf\Catalina\localhost 下新建一个和项目名相同的 projectName.xml 文件，文件内容如下
<Context docBase="F:\workspace\TestEclipse\WebContent" path="/TestEclipse"
workDir="F:\workspace\TestEclipse\WorKDir" reloadable="true" debug="0"/>
docBase：项目文件夹的web-inf文件夹的上一层目录
path：URL的入口地址，访问地址
wordDir：项目中将jsp转换成Java文件存放的地方
出现警告 [SetContextPropertiesRule]{Context} Setting property 'debug' to '0' did not find a matching property.
表示内容中 debug 属性被支持了，只要去除就可以了。
对于上面这个设置以后，启动服务器后，切记不要在项目上右键选择 Run As --> Run on Server（这样就会被Eclipse部署到服务器上去了）这样运行程序，而是启动服务器后，直接在浏览器输入地址去访问项目。（可以在Eclipse中启动服务器，也可以直接在外部启动服务器不过这样Eclipse中的Server就不知道）。
例如：http://localhost:8080/TestEclipse/View/test.jsp 这样就访问到了项目根目录下的 WebContent 目录下的 View 目录下的 JSP 页面。
设置虚拟目录后，每新建一个项目都要写一个对应的简单的配置文件放到 Tomcat8.5\conf\Catalian\localhost 下（基本是复制，只要修改项目名就可以了）。如果有多个项目很明显的影响了服务器启动的时间后，只需要简单的将不需要的使用的配置文件从目录下移除就可以了，需要时添加进去就行了。
Tomcat访问配置文件顺序：
每当我们访问一个项目的时候，tomcat 首先是到 Tomcat/conf/Catalina/localhost 目录下去察看有没有存在主目录或虚拟目录的xml文件，
如果有xml文件，就按xml里的路径进行访问，如果没有xml文件，就到 server.xml 文件里去察看是否配置 context 标签，
如果配置了 context 标签，则在 Tomcat/conf/Catalina/localhost 目录下生成一个对应的 xml 文件，以便于下次直接验证而不再访问 server.xml，
与此同时打开 context 里指定的路径，如果 server.xml 里没有配置 context 标签，则返回访问错误页面。
运行Web项目提示找不到类：
当我们的Web项目，需要使用到Java类时，要注意是否能被正确的编译到 WEB-INF/classes 目录下。
如果运行 web项目时，src下的 java类无法自动编译到 WEB-INF/classes 目录下
解决方法：
在菜单栏选择 project，勾选 Build Automaticly 菜单项。
运行后如果还不可以，Project -> Clean.. 选择第二项Clean projects selected below, 选择OK。(清除以前的编译信息，并重新编译)
如果 WEB-INF 下没有生成 classes 目录，那可能是默认编译文件目录设置错误了，需要手动设置
project->properties->java build path->source->src，将 Default output folder 设置为[项目名] /WebRoot/WEB-INF/classes ,点击OK。
（这也就是我们前面说到的，如果新建Dynamic Web Project 的第二步如果没有设置Default output folder，后面怎么修改）
如果以上3步依然无法解决问题，首先请检查项目是否报错，以及引用的jar包是否路径都正确。
jar路径不对的话，project->properties->java build path->Libraries,将jar路径不正确的引用remove了，然后Add Extenal JARs，重新添加jar包。
由于eclipse的编译是基于时间戳的判断机制的。
因此当你按build all的时候有些eclipse认为时间戳没有改变的类不会被编译。可以先clean下
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