文献管理软件概述
中国科学技术大学 罗昭锋 2011/03/14
一、时代背景
文献管理软件的诞生也是社会需求的产物。很多整天与文献打交道的人被文献郁闷了，然后就有了专门的文献管理软件。整天与文献打交道最多的无非是科研工作者，还有一类图书馆员以及文献发行者，不过后一类人群是少数。此处主要讨论科研工作者。
二、科研与文献的那点关系
孙武说，要知己知彼，才能百战不殆。牛顿说，我是站在巨人肩膀上的。所以，科研工作者开始知彼之路，寻找巨人的肩膀。第一步，就是要找到需要的文献，在次不多论述，因为讲文献检索的多如牛毛。找到之后能咋样？读呗！吭哧吭哧，读啊读，很多文献都是坑爹的，删！吭哧吭哧，继续读…… 终于有篇重要的文献。保存，建文件夹。哇噻，突然灵光一闪，思如泉涌，赶紧记下来，打开 word，记下自己的一闪灵光。吭哧吭哧，生活继续，读得文献越来越多，电脑已经建了很多文件夹。再读文献，经常碰到新的问题，这篇文献好像见过。翻出 google 强大的桌面搜索，一找果然看过。当时有记录么？岁月流逝，文献越来越多，渐渐记不清看过什么了，记不得看过的文献在哪儿了。要写文章的时候，找不到文献了，只好再重新下一遍。好不容易，写了一篇洋洋洒洒的论文，投稿前发现第五篇参考文献后面少引了一篇重要文献。崩溃，重新调整引文序号，原来的 6 变成 7，8 变9.……………………35 变成 36，终于完成了……
这估计目前大多数人与文献打交道的方式，基本算是原始社会的水平了。其实，一切可以更简单。
三、文献管理软件的一些基本功能
1、可以直接联网到不同的数据库进行检索，免去我们登录不同数据库的劳累之苦，并且提高了效率；
2、可以非常方便地管理文献信息，包括文摘、全文、笔记、以及其它的附件材料等等；省去我们建立一个又一个的文件夹；检索功能大大方便我们查找到需要的文献；多数软件还具备一定的分析功能；
3、文末参考文献格式的编辑；这个是体力活，不过使用软件就会轻松了许多。
四、学习文献管理软件的思路
上面讲到文献管理软件的基本功能之后，我们知道，这些软件无非是帮助我们更高效地管理文献。所以学习的思路，首先要弄明白怎么将文献交给软件管理，其实就是在软件中建立数据库的过程。当使用软件建立了数据库之后，我们就要知道，软件提供哪些管理功能，可以提高我们的工作效率。如果你需要写论文，还需要知道如何编辑参考文献格式。
以上是学习的基本思路，但不同的软件，操作上略有不同。针对具体软件，将在以后的博文中予以介绍。下面概要性介绍一下目前市面上的文献管理软件。
五、文献管理软件的分类及资源
关于文献管理软件的分类，未见专门的论述。个人认为可以有很多种分法。譬如，有免费的和收费的；有开源的和不开源的；有在线的和离线的，有跨平台的和不跨平台的，其中不跨平台的可能会有多种平台的版本软件。
（1）先说说国产的文献管理软件
国产的基本只有四家，分别是 noteexpress，notefirst，医学文献王和新科学。
NoteExpress 应该算是国产软件中的精品了，功能齐全，设计理念先进，有很多功能优于老牌的劲旅 Endnote。适合国人习惯，很容易上手。稳定性和设计细节还需进一步改进。推荐！由北京爱琴海公司开发，网址 www.reflib.org 或 http://www.scinote.com，最新版本: 2.6.1482 。
Notefirst 是基于 Science2.0 的理念，倡导共享与协作。结合了客户端和在线管理的优势，集成了文件管理，文献收集，论文中参考文献的自动形成，参考文献自动校对等功能。支持多种其他软件的文件格式，并集成了多语言系统。详细可以参考公司网站 http://www.notefirst.com，以及百度百科的词条 http://baike.baidu.com/view/3758548.htm。它由西安知先信息技术有限公司开发并提供技术支持，用户可免费下载，基本功能使用免费，但高级功能需要购买开通。目前最新版本：V1.4.1 2010.12.21 。
医学文献王，针对医学领域的专业化文献管理工具。由北京金叶天翔科技有限公司开发，网址，http://www.medscape.com.cn，未找到免费试用版，未进行测试。想了解可以到公司网站查看。
新科学是基于网络的文献管理与分享平台，理念是以文会友。不错的尝试，由几位热血青年创立。网址 www.xinkexue.com。
（2）国外的老牌单机版软件
知名度最高的要数 Endnote 了，每年更新一版，每次都有一些功能上的改进。是目前使用面最广，认可度最高的文献管理软件。网上可以找到很多教程。包括本人 07 年写的《文献管理与文献信息分析》电子手册，2009 年录制的“EndnoteX3 系列视频教程”等。网址 www.endnote.com，软件现在属于汤森路透公司。同属该公司的还有 reference manager 和 procite 两款知名的文献管理软件。不过，出于商业上的需要，后两款软件被收编之后，更新较少。公司主要的精力放在了 endnote 上。
Quosa 国内关注不多，也是一款比较有个性的软件。最早提供自动下载 PDF 全文（你要有权限）、能够追踪最新文献、目录可导入 Endnote、能进行全文文献分析等功能。值得尝试，资源目前主要局限于生命科学领域。网站：http://www.quosa.com/
还有一款软件叫 Biblioscape，公司网址 http://www.biblioscape.com，不过公司网站最后的更新到 2009 年 5 月 6 日，不知道为何近期没有更新。从公司主页介绍看节目类似 noteexpress 的目录导航，内置 pdf 浏览器，功能上未见特别出彩的地方。未使用过。
（3）国外免费的单机版软件
Jabref 是免费的跨平台文献管理软件。适用于 Windows，Linux 和 Mac OS X 系统。JabRef 最大的特点就是使用 BibTeX 格式的数据库，所以它最适合 LaTeX 用户使用。网址 http://jabref.sourceforge.net。
Bibus（windows 下推荐）：和 Endnote 功能差不多，支持在 Word 及 OpenOffice 中插入文献，自动生成参考文献目录。支持文献分组。使用 MySQL或 SQLite（任选其一）数据库储存参考文献数据。它能在 OpenOffice 及 MS Word 中直接插入引文，而无需在 Word 中安装宏，或插件什么的。并自动生成参考文献目录。其功能目前已与商业软件 Endnote，RM 接近，支持 Unicode，支持中文。网址 http://bibus-biblio.sourceforge.net。
（4）国外的在线文献管理软件
Mendeley 既有客户端，又支持在线管理，与 notefirst 类似。免费，可以自动导入 pdf 文献是它的特色。用来管理 pdf 文件也是不错的主意。同时它还引入了社会化功能，可以实现以文会友的功能。网址 www.mendeley.com 。
Zotero 算是比较独特的了，它只是一个 firefox 的插件，可以在线收集文献信息，并通过插件的形式进行管理。www.zotero.org 公司网站上有详细的中文介绍，不妨看一下 http://www.zotero.org/support/zh/quick_start_guide。
Endnote Web 是 endnote 的网络版，可以与桌面端同步数据，除了 WOS 的强大数据源之外，EndnoteWeb 与其它在线软件相比没有多少优势。管理较强，缺少互动。
除此之外，还有几家大型数据库上开发的在线文献管理工具，不过流传并不广泛。有兴趣者可以了解一下。分别是：
citeulike 是由 springer 集团开发的在线文献管理与分享平台。可以便捷存储网上的文献，最新还加入了文献自动推荐功能，可以与同事分享文章，也可以知道哪些人在读相同的文章，也可以保存和搜索 PDF 文件等。http://www.citeulike.org/。
Connotea，这是 Nature 出版集团旗下网站。借鉴当前流行的 delicious 等社会书签的创意，专注于科研领域，并可导入桌面文献管理软件的数据，是当前比较流行的一款在线文献管理工具。网址：http://www.connotea.org/ ，中文介绍可以参考
http://ncwf75.blog.163.com/blog/static/1144020092010829101435777/
2collab 是 Elsevier 出版集团旗下网站。 2collab 提供了一种可处理来自各种不同资源的学术信息的新方式，研究人员在这样一个平台上可以同其所在领域的同行进行沟通交流，进而一起探索、分享信息和相互协作。 网址：http://www.2collab.com。
以上包括了所有我目前所知道的文献管理软件和在线的文献管理平台。仅作了简单介绍，本博今后也会对部分软件进行介绍和培训，欢迎关注。至于本文的不妥之处，敬请指出。（文摘引用了网上几段文字，未一一标出）