ASP.NET Web应用程序与ASP.NET网站，这两者的区别？
WebApplication编程模型的优点：
●网站编译速度快，使用了增量编译模式，仅仅只有文件被修改后，这部分才会被增量编译进去。
●生成的程序集
WebSite：生成随机的程序集名，需要通过插件WebDeployment才可以生成单一程序集
WebApplication：可以指定网站项目生成单一程序集，因为是独立的程序集，所以和其他项目一样可以指定应用程序集的名字、版本、输出位置等信息
●可以将网站拆分成多个项目以方便管理
●可以从项目中和源代码管理中排除一个文件
●支持VSTS的Team Build方便每日构建
●更强大的代码检查功能，并且检查策略受源代码控制
●可以对编译前后进行自己规定的处理
●对App_GlobalResources 的Resource强类支持（网上说的，还没有了解过）
●直接升级使用VS2003构建的大型系统
WebSite编程模型的优点：
●动态编译该页面，马上可以看到效果，不用编译整个站点（主要优势）
●同上，可以使错误的部分和使用的部分不相干扰（可以要求只有编译通过才能签入）
●可以每个页面生成一个程序集（不会采用这种方式）
●可以把一个目录当做一个Web应用来处理，直接复制文件就可以发布，不需要项目文件（无所谓，只适合小站点）
●可以把页面也编译到程序集中（应该用不到，而且WebApplication也可以通过WebDeployment插件来实现）
两种编程模型的互相转换：
VS2005 SP1内置了转换程序，可以非常方便的从WebSite转换到WebApplication
只需要复制文件，右键执行“转换为Web应用程序”即可。
未查到有专门的反向转换工具，但比较后发现如果转换也非常简单。
删除所有*.designer.cs
将*.aspx、*.ascx、*.master页面文件中的 Codebehind="FileList.aspx.cs" 批量替换成 CodeFile="FileList.aspx.cs"
优先选择 Web 应用程序项目的情况包括：
需要在不停止调试会话的情况下能够编辑代码。
需要对与 ASP.NET 页关联的类文件中的代码运行单元测试。
需要从独立类中引用与页和用户控件关联的类。
您希望在多个 Web 项目之间建立项目相关性。
您希望编译器为整个站点创建单个程序集。
您要控制为站点生成的程序集的名称和版本号。
需要使用 MSBuild 或 Team Build 编译项目。 例如，您可能希望添加预先生成和后期生成步骤。
需要避免将源代码放置在生产服务器上。
需要使用 Visual Studio 2010 中提供的自动化部署工具。
优先选择网站项目的情况包括：
需要在单个 Web 项目中同时包含 C# 和 Visual Basic 代码。 （默认情况下，是根据项目文件中的语言设置编译 Web 应用程序的。 可以设置例外情况，但相对较难。）
需要在 Visual Studio 中打开生产站点和使用 FTP 对其进行实时更新。
不希望必须显式编译项目才能部署项目。
如果预编译站点，您希望编译器为站点创建多个程序集，可以是每个页面或用户控件一个程序集，也可以是每个文件夹一个或多个程序集。
您希望能够通过仅将新版本复制到生产服务器，或通过在生产服务器上直接编辑文件来更新生产中的各个文件。
如果预编译站点，您希望能更新各 ASP.NET 网页（.aspx 文件），而无需重新编译整个网站。
您希望在生产服务器上保留源代码，以便用作附加备份副本。
详细链接:http://msdn.microsoft.com/zh-cn/library/dd547590.aspx