博主之前参与的一个科研项目是用 LSTM 结合 Attention 机制依据作物生长期内气象环境因素预测作物产量。本篇博客将介绍如何用 keras 深度学习的框架搭建 LSTM 模型对时间序列做预测。所用项目和数据集来自:真实业界数据的时间序列预测挑战。
1 项目简单介绍
1.1 背景介绍
本项目的目标是建立内部与外部特征结合的多时序协同预测系统。数据集采用来自业界多组相关时间序列(约40组)与外部特征时间序列(约5组)。课题通过进行数据探索,特征工程,传统时序模型探索,机器学习模型探索,深度学习模型探索(RNN,LSTM等),算法结合,结果分析等步骤来学习时序预测问题的分析方法与实战流程。
1.2 数据集说明
** 训练数据有8列:**
- 日期 - 年: int- 日期 - 月: int
- 日期 - 日: int, 时间跨度为2015年2月1日 - 2016年8月31日
- 当日最高气温 - 摄氏度(下同): float
- 当日最低气温: float
- 当日平均气温: float
- 当日平均湿度: float
- 输出 - float
预测数据没有输出部分,其他与预测一样。时间跨度为2016年9月1日 - 2016年11月30日
训练与预测都各自包含46组数据,每组数据代表不同数据源,组之间的温度与湿度信息一样而输出不同.
2 导入库并读取查看数据
#查看其中一个地区的训练数据
import pandas as pd
import numpy as np
from keras.models import Sequential
from keras.layers import Dense, LSTM, Dropout
import matplotlib.pyplot as plt
% matplotlib inline
import glob, os
import seaborn as sns
import sys
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
columns = ['YEAR','MONTH','DAY','TEMP_HIG','TEMP_COL','AVG_TEMP','AVG_WET','DATA_COL']
data = pd.read_csv('../input/industry/industry_timeseries/timeseries_train_data/1.csv',
names=columns)
data.head()
# 查看数据采集区1的数据
plt.figure(figsize=(24,8))
for i in range(8):
plt.subplot(8, 1, i+1)
plt.plot(data.values[:, i])
plt.title(columns[i], y=0.5, loc='right')
plt.show()
3 数据预处理
3.1 时间序列数据转化为监督问题数据
def series_to_supervised(data, n_in=1, n_out=1, dropnan=True):
n_vars = 1 if type(data) is list else data.shape[1]
df = pd.DataFrame(data)
cols, names = list(), list()
# input sequence (t-n, ... t-1)
for i in range(n_in, 0, -1):
cols.append(df.shift(i))
names += [('var%d(t-%d)' % (j+1, i)) for j in range(n_vars)]
# forecast sequence (t, t+1, ... t+n)
for i in range(0, n_out):
cols.append(df.shift(-i))
if i == 0:
names += [('var%d(t)' % (j+1)) for j in range(n_vars)]
else:
names += [('var%d(t+%d)' % (j+1, i)) for j in range(n_vars)]
# put it all together
agg = pd.concat(cols, axis=1)
agg.columns = names
# drop rows with NaN values
if dropnan:
agg.dropna(inplace=True)
return agg
关于上段代码的理解可以参考:How to Convert a Time Series to a Supervised Learning Problem in Python
# 将数据归一化到0-1之间,无量纲化
scaler = MinMaxScaler(feature_range=(0,1))
scaled_data = scaler.fit_transform(example[['DATA_COL','TEMP_HIG','TEMP_COL','AVG_TEMP','AVG_WET']].values)
# 将时序数据转换为监督问题数据
reframed = series_to_supervised(scaled_data, 1, 1)
#删除无用的label数据
reframed.drop(reframed.columns[[6,7,8,9]], axis=1, inplace=True)
print(redf.info())
redf.head()
3.2 数据集划分及规整
# 数据集划分,选取前400天的数据作为训练集,中间150天作为验证集,其余的作为测试集
train_days = 400
valid_days = 150
values = redf.values
train = values[:train_days, :]
valid = values[train_days:train_days+valid_days, :]
test = values[train_days+valid_days:, :]
train_X, train_y = train[:, :-1], train[:, -1]
valid_X, valid_y = valid[:, :-1], valid[:, -1]
test_X, test_y = test[:, :-1], test[:, -1]
# 将数据集重构为符合LSTM要求的数据格式,即 [样本,时间步,特征]
train_X = train_X.reshape((train_X.shape[0], 1, train_X.shape[1]))
valid_X = valid_X.reshape((valid_X.shape[0], 1, valid_X.shape[1]))
test_X = test_X.reshape((test_X.shape[0], 1, test_X.shape[1]))
print(train_X.shape, train_y.shape, valid_X.shape, valid_y.shape, test_X.shape, test_y.shape)
(400, 1, 5) (400,) (150, 1, 5) (150,) (27, 1, 5) (27,)
4 建立模型并训练
model1 = Sequential()
model1.add(LSTM(50, activation='relu',input_shape=(train_X.shape[1], train_X.shape[2]), return_sequences=True))
model1.add(Dense(1, activation='linear'))
model1.compile(loss='mean_squared_error', optimizer='adam')
# fit network
LSTM = model.fit(train_X, train_y, epochs=100, batch_size=32, validation_data=(valid_X, valid_y), verbose=2, shuffle=False)
# plot history
plt.plot(LSTM.LSTM['loss'], label='train')
plt.plot(LSTM.LSTM['val_loss'], label='valid')
plt.legend()
plt.show()
5 模型预测并可视化
plt.figure(figsize=(24,8))
train_predict = model.predict(train_X)
valid_predict = model.predict(valid_X)
test_predict = model.predict(test_X)
plt.plot(values[:, -1], c='b')
plt.plot([x for x in train_predict], c='g')
plt.plot([None for _ in train_predict] + [x for x in valid_predict], c='y')
plt.plot([None for _ in train_predict] + [None for _ in valid_predict] + [x for x in test_predict], c='r')
plt.show()
蓝色曲线为真实输出
绿色曲线为训练数据的预测输出
黄色曲线为验证数据集的预测输出
红色曲线为测试数据的预测输出(能看出来模型预测效果还是比较好的)
6 小结
本次只采用了一个地区的数据用来训练模型,在后续的工作中可以增加多任务学习内容。