文件名称:Irys-scaffolding:脚本来解析IrysView输出
文件大小:23.76MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-15 02:24:39
Perl
艾尔斯脚手架 软件引用: 论文引用:詹妮弗·玛丽·谢尔顿,米歇尔·C·科尔曼,尼克·赫恩登,南燕·路,欧内斯特·T·林,托马斯·安纳塔拉曼,帕拉克·谢斯,苏珊·J·布朗。 用于BioNano数据的工具和管道:分子组装管道和FASTA超级脚手架工具。 bioRxiv doi: ://dx.doi.org/10.1101/020966 脚本来解析IrysView输出 KSU_bioinfo_lab #BioNano数据的管道 K-INBRE生物信息学核心已经为BioNano分子图谱或预先组装的BioNano基因组图谱创建了易于使用的管道,用于几种常见的组装和/或比对实验。 所有管道都有样本数据集和教程。 管道会将您从从制图设备或组装的基因组图接收到的原始数据带到最终分析。 使用这些脚本之前,无需具有命令行经验。 ## Pipeline 1:缝纫机流水线:使用stitch.pl