matlab分时代码-gillespie-algorithm-python:了解Gillespie算法并在Python中自己构建

时间:2024-06-10 12:48:18
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文件名称:matlab分时代码-gillespie-algorithm-python:了解Gillespie算法并在Python中自己构建

文件大小:12.07MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-10 12:48:18

系统开源

matlab分时代码使用Python的Gillespie算法 目标 了解Gillespie算法,并使用Python自己构建。 要求 Python 2.7(我们建议使用Anaconda发行版,其中包含大多数必需的模块) 模组:NumPy,SciPy 补习指南 您应该拥有的文件:名为build_your_own_gillespie.ipnb的ipython笔记本 要启动ipython笔记本: 在Mac上: 启动一个新的终端窗口,然后键入“ jupyter notebook”,然后按Enter。 当新的浏览器窗口打开时,导航至保存教程的文件夹。 单击您要遵循的教程。 在Windows上: 打开命令提示符(cmd); 在命令提示符下,将当前路径更改为包含教程或其任何父目录的目录(cd [disk_label]:/ path / to / directory)(否则,稍后我将无法导航至浏览器中所需的文件夹); 然后您可以从命令提示符下运行“ jupyter笔记本”。 使用Jupyter笔记本:要在单元格中键入代码时,只需单击它即可将其激活。 当您要运行代码时,请按Shift + Enter。 您


【文件预览】:
gillespie-algorithm-python-master
----.ipynb_checkpoints()
--------build_your_own_gillespie-checkpoint.ipynb(309KB)
--------build_your_own_gillespie_solutions-checkpoint.ipynb(283KB)
--------deterministic_modelling-checkpoint.ipynb(2KB)
--------build_your_own_gillespie_exercises-checkpoint.ipynb(73KB)
----reaction_rate1.png(8KB)
----c2.png(40KB)
----r2.png(13KB)
----explainign_gillespie.key.zip(2.58MB)
----diag.png(39KB)
----ode1.png(44KB)
----sample.png(25KB)
----pdff.png(140KB)
----r1.png(13KB)
----build_your_own_gillespie_exercises.ipynb(73KB)
----README.md(2KB)
----schematic1.png(68KB)
----a.png(29KB)
----algo_im.png(86KB)
----c1.png(73KB)
----b.png(105KB)
----choice.png(97KB)
----a0.png(42KB)
----pdf.png(43KB)
----Papers()
--------Gillespie1976.pdf(1.98MB)
--------Gillespie1977.pdf(3.23MB)
--------Erban2007.pdf(759KB)
----MATLAB-Gillespie()
--------nedelec_gillespie_choice.m(392B)
--------nedelec_francois_gillespie.m(2KB)
----explainign_gillespie.key(5.62MB)
----alg.png(95KB)
----build_your_own_gillespie_solutions.ipynb(283KB)

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