文件名称:microeco:用于微生物群落生态学数据分析的R包
文件大小:7.43MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-07 08:21:56
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微生态 用于微生物群落生态学数据挖掘的R包 背景 在微生物群落生态学中,随着高通量测序技术的发展,数据量的增加和复杂性的增加使群落数据的分析和管理面临挑战。 已经为微生物组分析创建了许多R包,例如phyloseq,microbiomeSeq,ampvis2,mare和microbiome。 但是,仍然难以快速有效地执行数据挖掘。 基于此,我们创建了R包microeco。 主要特点 R6类,用于存储和分析数据; 快速,灵活和模块化 分类学丰度分析 维恩图 字母多样性 Beta多样性 微分丰度分析 指标种类分析 环境数据分析 空模型分析 网络分析 功能分析 安装R / RStudio 如果尚未安装R / RStudio,请执行以下操作。 安装 安装 将R放入计算机环境路径中,例如your_directory \ R-4.0.0 \ bin \ x64 打开RStudio ...工具.
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