文件名称:seir传染病模型matlab代码-summerProject2020Tiainen:夏天项目2020
文件大小:20KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-11 14:51:23
系统开源
seir传染病模型模型夏天项目2020 介绍 该存储库包含一个简单的模拟和一些探索性代码,以伴随有关狄拉克型流行病的理论结果(在其他地方)。 两个主要部分是: 1个R代码,用于生成具有不同参数和假设的流行病。 所有代码都是用R编写的,灵感来自iGraph和[2,3](均在主文件夹中) 2 Matlab代码(在/ R0目录中),用于示例1.4.5的探索。 [1]的内容,包括功能和一个示例文件,供您探索 运行和技术细节 R代码仅使用两个非标准程序包,即前面提到的“ iGraph”(功能不需要,仅在探索性代码的一部分中使用)和“ collection”(请参阅参考资料)。 使用的R版本是3.6.1,但是较早的版本可能也足够了。 Matlab是用R2020a版本编写的,并使用了Symbolic Math Toolbox:trade_mark:中的vpasolve-function。 R-模型说明 我们通过假设个体的随机传染性来对流行病的行为(或者俱乐部访问等流行病事件)进行建模。 也就是说,指示词属于两种类型之一,所有传染性都集中在一个时间点上。 因此,受感染的个体在一段时间内仍保持感染状态,此后他们在感染结束
【文件预览】:
summerProject2020Tiainen-master
----utilityFunctions.R(9KB)
----.gitignore(40B)
----contSimul.R(4KB)
----README.md(6KB)
----estimatorsBothCases.R(5KB)
----summerProject2020Tiainen.Rproj(205B)
----exploratoryCode.R(11KB)
----discreteSimul.R(3KB)
----Matlab()
--------calcR0_H.m(145B)
--------summer2020.asv(4KB)
--------summer2020.m(3KB)
--------R0_at_end.m(212B)
--------plotR0_N_over_R0_H.m(365B)
--------plot_R0_over_ka.m(590B)
--------calcR0_N.m(385B)
--------e_to_a_convergence.m(448B)