文件名称：matlab匹配滤波代码-edge_staining_quantification:MATLAB代码以量化边缘染色
文件大小：5KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 19:57:57
系统开源
matlab匹配滤波代码边缘和囊泡染色定量 该MATLAB脚本从两组图像中分割了边缘和囊泡，然后计算了这些结构的属性。 它最初是为E-钙黏着蛋白染色与继发性囊泡染色配对而开发的，尽管任何带有边缘和囊泡标签的图像集都可以使用。 使用高通滤波器和基于已滤波图像的标准偏差的阈值对边缘污点明显的图像进行分割。 使用类似的技术从辅助图像中分割出囊泡，并在囊泡的大小上添加一些其他过滤器。 该代码还尝试查找确实包含任何单元格的图像背景区域。 找到这些结构后，将产生一组可视化效果，以显示在何处识别出边缘和囊泡。 最后，对边缘和囊泡的某些特性进行了量化。 使用代码 主要脚本是“ stain_quant.m”，它对如何组织数据进行了一些假设。 唯一需要的输入是目录，该目录应包含一组需要处理的图像。 其他选项不是必需的，但可能需要自定义以匹配您的成像条件和文件命名结构。 exp_dir（必需）：包含边缘和囊泡染色图像的目录 edge_search_str（可选）：用于在exp_dir中搜索边缘图像的字符串 secondary_search_str（可选）：用于在exp_dir中搜索囊泡图像的字符串 back
【文件预览】：
edge_staining_quantification-master
----stain_quant.m(7KB)
----LICENSE(1KB)
----make_config_file.m(126B)
----README.md(4KB)
----.gitignore(11B)