文件名称：matlab匹配滤波代码-Infection_mound_volume:Infection_mound_volume
文件大小：3.72MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 19:53:27
系统开源
matlab匹配滤波代码Infection_mound_volume 该文件夹包含：（1）以单核细胞增生李斯特氏菌感染丘为中心的宿主MDCK核（用DAPI染色）的代表性共聚焦堆叠； （2）将原始数据转换为二进制图像堆栈的代码； （3）通过运行代码获得的二值化土堆。 它还包含一个在二值化过程中从原子核图像中减去的背景图像和一个用于校正不均匀照明的平场图像。 matlab文件的第二部分包含用于将二值化后的图像转换为alpha形状并通过为每个切片添加alpha形状的面积并乘以切片之间的增量来获得土墩体积的代码。 标题为1control_1.tif的文件包含从显微镜获得的图像堆栈，可以将其读取到名为mound_volume_calculation.m的matlab文件中，以输出标题为tile1.TIFF的文件，该文件表示感染丘的二值化。 由于它的大小，我们无法在这里上传它，但您可以从下载：。 标题为MED_60X_1X_background_3_MMStack_Pos0_1.ome.tif的背景图像和标题为MED_Concatenated Stacks.tif的平场图像也被读入名为mound_
【文件预览】：
Infection_mound_volume-main
----MED_Concatenated Stacks.tif(4MB)
----mound_volume_calculation.m(19KB)
----Background_and_Flatfield_correction_instructions.docx(15KB)
----README.md(5KB)
----MED_60X_1X_background_3_MMStack_Pos0_1.ome.tif(4MB)
----tile1.TIFF(15.96MB)