文件名称：geneview：使用matplotlib进行基因组数据可视化的python软件包
文件大小：17.94MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-26 00:12:07
visualization python pandas data-visualization matplotlib
Geneview：用于基因组数据可视化的python软件包 Geneview是基于matplotlib的Python可视化库。 它提供了用于绘制有吸引力的基因组图形的高级界面。 现在它正在积极开发。 文献资料 例子 我们使用存储库中的数据集GOYA_preview作为以下图的输入。 这是GOYA_preview的格式预览： 曼哈顿情节的基本示例。 import matplotlib.pyplot as plt import geneview as gv df = gv.util.load_dataset('GOYA_preview') # df is DataFrame of pand
【文件预览】：
geneview-master
----setup.py(3KB)
----.gitignore(136B)
----requirements.txt(37B)
----licences()
--------HUSL_LICENSE(1KB)
--------SIX_LICENSE(1KB)
--------SEABORN_LICENSE(1KB)
----examples()
--------hex.pdf(13KB)
--------data()
--------ex_jointplot.py(342B)
--------ex_qq.py(366B)
--------ex_manhattan.py(592B)
--------ex_karyoplot.py(266B)
--------qq.png(32KB)
--------ex_fastq.py(205B)
--------manhattan.png(167KB)
--------ex_hist2d.py(227B)
--------ex_manhattan2.py(600B)
----README.md(3KB)
----docs()
--------.gitignore(8B)
--------Makefile(7KB)
--------index.rst(429B)
--------conf.py(11KB)
--------_static()
--------tutorial()
----geneview()
--------gwas()
--------ext()
--------__init__.py(416B)
--------karyotype()
--------baseplot()
--------util()
--------tests()
--------genome()
--------palette()
--------io()