pr2database:Protist核糖体参考数据库(PR2)-SSU rRNA基因数据库

时间:2021-05-04 02:55:10
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文件名称:pr2database:Protist核糖体参考数据库(PR2)-SSU rRNA基因数据库
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更新时间:2021-05-04 02:55:10
database taxonomy metabarcoding rrna 18s pr2数据库 Protist核糖体参考数据库(PR 2 ) SSU rRNA基因数据库 是在BioMarks项目框架下于2010年启动的,该项目是基于Roscoff站生物物流的浮游生物小组在过去十年中开发的。 其目的是提供使用八个独特的分类领域(从王国到物种)精心注释的18S rRNA序列的参考数据库。 目前,它包含约184,000个序列。 许多元数据字段可用于许多序列,包括地理定位(无论它是源自文化还是自然样本,宿主类型等)。PR2的注释由每个分类组的专家执行。 在这方面,一个非常重要的项目是 ,该公司最近决定将其工作与PR 2合并。 EukRef建立了生物信息学管道,该管道已在三个专门针对特定生物分类学的研讨会上使用。 当前版本 当前版本:4.13.0 最近更新:2021年3月17日 下载PR2 install.packages( devtools ) devtools :: ins

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