HADA protocol-开源

时间:2024-05-17 19:08:42
【文件属性】:

文件名称:HADA protocol-开源

文件大小:2.12MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-17 19:08:42

开源软件

用于实现用于序列比对的分层注释相关比对(HADA)协议的脚本以及相关功能。


【文件预览】:
sql
----all_scripts.sql(24KB)
----CVS()
--------Entries(52B)
--------Entries.Extra(26B)
--------Repository(5B)
--------Entries.Old(41B)
--------Entries.Extra.Old(26B)
--------Root(56B)
perl
----gc_bogs_aligned.pl(4KB)
----CVS()
--------Entries(411B)
--------Entries.Extra(224B)
--------Repository(6B)
--------Entries.Old(323B)
--------Entries.Extra.Old(224B)
--------Root(56B)
----assemble_composites.pl(31KB)
----generate_alignments.pl(18KB)
----random_alignments.pl(14KB)
----gc_ath_elements.pl(13KB)
----gene_pairs.pl(2KB)
----gc_bogs.pl(4KB)
----parse_waba.pl(8KB)
doc
----Brassica Ensembl A genome.bmp(2.83MB)
----alignment_schema.txt(5KB)
----Brassica Ensembl B genome.bmp(2.83MB)
----Brassica Ensembl C genome.bmp(2.83MB)
----20060228 RSS Talk Jay Moore.ppt(923KB)
----CVS()
--------Entries(622B)
--------Entries.Log(13B)
--------Entries.Extra(388B)
--------Repository(5B)
--------Entries.Old(611B)
--------Entries.Extra.Old(388B)
--------Root(56B)
----20060524 UKBRC Talk Jay Moore.ppt(1.14MB)
----Brassica Ensembl C genome chrom 3 - Ath collinearity.bmp(2.83MB)
----Brassica Ensembl Home Page.bmp(2.83MB)
genstat
----fit_line_0-300.gen(695B)
----CVS()
--------Entries(262B)
--------Entries.Extra(144B)
--------Repository(9B)
--------Entries.Old(207B)
--------Entries.Extra.Old(144B)
--------Root(56B)
----fit_hyp_0-300.gen(9KB)
----fit_const_0-300.gen(2KB)
----fit_exp_0-300.gen(872B)
----fit_gomp_0-300.gen(1KB)

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