文件名称：segmentify:Python图像分割插件
文件大小：16.02MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-17 10:04:00
Python
细分 Segmentify是用于多维图像查看器的交互式通用单元格分段插件。 在上面的示例中，用户正在使用segmentify来分割图像中所有细胞的细胞核，细胞质和背景。 用户使用画笔工具在标签层上标记一些培训示例。 使用预训练的特征化器对整个图像进行特征化，并使用选定的示例来训练随机森林分类器。 最后，训练有素的分类器用于预测所有剩余的未标记像素的标记，并且在分割标签层处显示分割输出。 使用来自动生成GUI元素，该GUI元素可用于选择哪一层将是输入层，以及哪一层将提供训练标签。 安装 Segmentify可以使用pip安装 pip install segmentify 将Segmentify添加到napari 要将脚本中的segmentify功能添加到napari，您可以执行以下操作： import napari from segmentify import segmentat
【文件预览】：
segmentify-master
----MANIFEST.in(59B)
----segmentify()
--------util.py(3KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------_key_bindings.py(3KB)
--------model()
--------semantic()
--------__init__.py(290B)
--------gui.py(1KB)
--------instances()
----requirements.txt(145B)
----examples()
--------.DS_Store(6KB)
--------hpa.png(196KB)
--------launch.py(746B)
--------hpa_labels.tif(2MB)
----LICENSE(1KB)
----setup.cfg(40B)
----setup.py(2KB)
----README.md(5KB)
----.gitignore(1KB)
----figs()
--------next.gif(142KB)
--------fill_holes.gif(565KB)
--------erosion.gif(219KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------seg_example.gif(681KB)
--------label_morph.gif(204KB)
--------intro.png(1.05MB)
--------segmentify.gif(3.63MB)
--------dilation.gif(179KB)
--------seg_morph.gif(821KB)