文件名称：latticeproteins:实现蛋白质的晶格模型，并允许它们进化
文件大小：416KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-30 18:44:45
Python
晶格蛋白质模拟器 这是一个由编写并由扩展的格子蛋白质模拟器。 该模拟器已在以下出版物中使用； 如果您使用此程序，请引用这些出版物： 该软件是根据，这意味着只要您保留该许可证，您就可以随意使用该软件进行任何您想要的操作。 不幸的是，在我意识到包级文档的适当程序之前，我在攻读博士学位时就编写了这个软件包。 因此，尽管源代码有很好的文档记录，但没有任何更高级别的文档。 该包是用 Python 编写的。 应该适用于 Python 2 的最新版本（例如 2.7 和可能的 2.6）。 已将移植到 Python 3。 该程序使用了一些 C 扩展，因此编译需要gcc编译器。 要从源安装软件包： python setup.py build sudo python setup.py install 该软件包通过对整个构象进行求和来计算分配函数，从而计算模型内的精确热力学稳定性。 运行时，它首先创
【文件预览】：
latticeproteins-master
----README.rst(2KB)
----src()
--------evolution.py(40KB)
--------sequences.py(16KB)
--------contactlooper.c(15KB)
--------old_files()
--------interactions.py(6KB)
--------stats.py(46KB)
--------fitness.py(10KB)
--------__init__.py(138B)
--------conformations.py(49KB)
----examples()
--------visualize_conformations.py(935B)
--------disulfide_entropies()
--------build_and_time_conformations.py(1KB)
----setup.py(571B)
----.gitignore(23B)
----LICENSE.txt(32KB)