文件名称:darkspaceproject:试图找出有多少需要策展的地方。
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更新时间:2024-05-23 03:52:29
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黑暗空间项目 试图找出那里需要策展的地方... 描述和目标 这个项目的目的是试图找出尚未公开的分子相互作用数据的数量,而这些数据还没有被分子相互作用数据库(特别是符合IMEx的数据库)进行整理。 几种不同的策略将用于此目的,并且将以表格的形式生成估算的综合视图。 策略清单 这是为了获得估计而考虑的不同方法的列表。 其中一些将不会提供潜在的交互作用来进行策划,但是它们可用于对使用其他方法生成的列表进行排名。 外部资源清单 途径推断: Reactome推断对: 通过将它们与作为输入,输出或催化剂的React相关联来推断蛋白质对。 该数据集由Reactome( )团队生成,并为每个对提供具有关联PMID的对。 数据不是草稿 STRING路径推断: STRING( )从途径数据库(例如KEGG或Reactome)获取蛋白质-蛋白质关联,并推断它们代表蛋白质-蛋白质相互作用。 从STR