文件名称:CoV-IRT-Micro
文件大小:33KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-02 05:08:02
Python
CoVIRT-Micro工具 这些是微生物亚组在使用的脚本的集合。 我们可以在找到该项目的OSF网站。 conda安装 conda create -y -n covirt-micro -c conda-forge -c bioconda -c defaults -c astrobiomike covirt-micro conda activate covirt-micro 所有程序都以cov-为前缀。 可以使用cov-version访问版本信息。
【文件预览】:
CoV-IRT-Micro-main
----cov-version(306B)
----cov-kraken2-to-taxon-summaries(5KB)
----cov-summarize-go-annotations(11KB)
----cov-slim-down-go-terms(3KB)
----cov-combine-uniprot-ID-counts(2KB)
----LICENSE(34KB)
----cov-summarize-go-annots-w-domains(16KB)
----cov-combine-go-summaries-with-domains(4KB)
----cov-get-lineage-from-taxids(2KB)
----cov-update-go-dbs(861B)
----helper-cov-update-tax-table-for-seqscreen-go-tax-summary.sh(473B)
----README.md(592B)
----cov-propagate-go-terms(6KB)
----cov-combine-kraken2-taxon-summaries(4KB)