文件名称：uniqtag-paper:唯一标签
文件大小：1.46MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-28 05:13:08
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抽象的 在进行正在进行的基因组测序和组装项目时，当基因标识符从一个组装版本更改为下一个版本时，会相当不方便。 此处描述的基因标记系统 UniqTag 解决了这一常见挑战。 UniqTag 为每个基因分配一个唯一标识符，该标识符是一个代表k聚体，一个长度为k的字符串，选自该基因的序列。 与序列号不同，这些标识符在相同数据的不同程序集和注释之间是稳定的，而不需要通过序列比对将先前的注释解除。 我们将 UniqTag 标识符分配给跨越八年的 Ensembl 人类基因组的十个版本，以证明这种稳定性。 UniqTag 在 Ruby 中的实现和 R 包可在。 R 包也可从 CRAN 获得： install.packages("uniqtag") 。 可在获得补充材料和重现它的代码。 介绍 注释基因组序列的基因的任务通常遵循基因组组装。 这些带注释的基因被分配了唯一的标识符，可以通过这些标识符进行引用
【文件预览】：
uniqtag-paper-master
----UniqTag.md(14KB)
----UniqTag-header.tex(2KB)
----UniqTag.tex(16KB)
----UniqTag.bib(2KB)
----data()
--------uniqtag(1KB)
--------Makefile(5KB)
----UniqTag-footer.tex(15B)
----index.html(16KB)
----UniqTag.pdf(316KB)
----UniqTag-supp.md(24KB)
----UniqTag-supp.Rproj(225B)
----UniqTag-supp.pdf(226KB)
----UniqTag-supp.tsv(6KB)
----.gitignore(277B)
----figure()
--------ensembl.png(123KB)
--------k.png(110KB)
----Makefile(2KB)
----plos2009.bst(27KB)
----README.md(14KB)
----UniqTag-supp.html(1.41MB)
----UniqTag-supp.Rmd(4KB)