文件名称：建模指标
文件大小：9KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-16 21:19:37
R
建模Indel 该项目包含部分（并非全部）脚本，这些脚本用于构建HIV-1基因突变的自定义经验模型。 为此，我编写了一个自定义的马尔可夫链蒙特卡洛采样器，用于采样所选参数值的后验分布。 我们需要一个定制的MCMC采样器，以便将遗传序列重建步骤整合到采样器本身中。 本质上，此代码旨在模拟特定生成模型下在患者来源的HIV-1序列数据中观察到的特定突变（插入和删除）。 在当前状态下，它能够将这些插入/删除突变重构到中等/高准确度。
【文件预览】：
modeling-indels-main
----src()
--------mcmc-trace.r(4KB)
--------slippage-model.r(6KB)
--------slip-model-utils.r(6KB)
--------model-testing-4-1.R(5KB)
----README.md(698B)