GuideMaker:测试曲奇刀

时间:2024-04-29 20:43:15
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文件名称:GuideMaker:测试曲奇刀

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文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-29 20:43:15

Python

GuideMaker:针对任何小型基因组中的任何CRISPR-Cas系统的全球设计指南RNA 作者 佛罗里达大学微生物学和细胞科学系Ravin Poudel博士 佛罗里达大学微生物学和细胞科学系Lidimarie Trujillo 佛罗里达大学微生物学和细胞科学系Christopher Reisch博士 美国农业部农业研究服务部Adam R. Rivers博士 安装 GuideMaker可以从以下位置安装: Github存储库: : git clone https://github.com/USDA-ARS-GBRU/GuideMaker.git 依存关系 pybedtools NMSLib Biopython Pandas Streamlit for webapp altair for plotting 用法 GuideMaker: Globally design


【文件预览】:
GuideMaker-main
----setup.py(1KB)
----.gitignore(1KB)
----conda.recipe()
--------meta.yaml(1KB)
----guidemaker()
--------data()
--------__init__.py(502B)
--------cli.py(10KB)
--------_version.py(18KB)
--------app.py(8KB)
--------core.py(39KB)
----.travis.yml(869B)
----MANIFEST.in(141B)
----docker-images()
--------nonavx()
--------avx()
----LICENSE(1KB)
----setup.cfg(672B)
----.github()
--------workflows()
----README.md(4KB)
----.codacy.yml(136B)
----tests()
--------__init__.py(0B)
--------test_core.py(10KB)
--------GridOptimization.ipynb(55KB)
--------test_data()
----versioneer.py(67KB)
----appveyor.yml(2KB)
----.coveragerc(113B)
----.circleci()
--------config.yml(1KB)
----.gitattributes(55B)

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