inStrain:应变中的生物信息学计划

时间:2024-05-23 08:09:13
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文件名称:inStrain:应变中的生物信息学计划

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更新时间:2024-05-23 08:09:13

Python

应变 inStrain是一个python程序,用于分析来自元基因组的共现基因组种群,该程序可进行高度准确的基因组比较,覆盖率,微多样性和连锁性分析,以及具有基因定位和同义非同义词识别功能的灵敏SNP检测。 上提供了手册,安装说明和预期的输出 该出版物可在《和《 上 安装选项 点子 $ pip install instrain 生物conda $ conda install -c conda-forge -c bioconda -c defaults instrain 码头工人 Docker镜像在上的Docker Hub上。 有关使用说明,请参阅 。 快速开始 显示程序帮助和模块: $ inStrain -h 微多样性和SNP呼叫管道: $ inStrain profile mapping.bam genome_file.fasta -o inStrain_profile1 详细的应变


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