QMEE:qmee类的回购

时间:2024-04-24 00:39:49
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更新时间:2024-04-24 00:39:49

R

me 作业1 我本周分配的数据集包括一个分类表,一个asv表和一个样本图。 该数据来自Bowdish实验室先前的一项横断面研究,该研究于2016-2018年进行,目的是观察呼吸道感染前后上呼吸道(URT)的前鼻Kong和口腔的成分变化。 样本图包括44个人的ID号,年龄,性别,样本类型和捐赠时间点。 从鼻拭子和唾液拭子提供样品,并在基线(9月至11月),感染(或“事件”,10月至2月)和随访(3月至8月)期间收集。 在鼻腔和唾液样本的v3和v4区域中使用16S rRNA测序对数据进行测序。 我对此数据集有一些生物学问题,包括“老年人的URT微生物组在感染后会重新稳定吗?”,“ URT微生物组的成分变化如何导致呼吸道感染?” 以及“ URT微生物组稳定性如何在年轻人和老年人体内感染前后波动?” 作业2 我想调查健康成年人中URT微生物组与年龄相关的变化。 我将使用alpha和beta分集


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QMEE-main
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----nasalvssaliva boxplot.svg(59KB)
----cleandata.R(4KB)
----assignment6_diss_alternate.txt(3KB)
----assignment7.R(6KB)
----A3sub.R(6KB)
----Hypothesis for my data.txt(3KB)
----assignment5_diss.txt(2KB)
----A3READ.md(5KB)
----MMV Question.txt(1KB)
----assignment1.R(5KB)
----calibration_data.bug(222B)
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----nasal vs saliva.svg(175KB)
----qmee.Rproj(205B)

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