文件名称:ezancestry:可视化您的个人遗传数据
文件大小:482KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-02-26 00:14:20
genomics data-visualization ancestry dimensionality-reduction genomics-visualization
易学 一千个基因组计划-使用Streamlit进行人口可视化 ezancestry是使用在Python中构建并部署在上的交互式可视化应用程序。 在查看您的基因型 本地安装和使用 ezancestry可以在本地安装: 下载ezancestry 转到ezancestry目录: $ cd ezancestry 创建一个: $ python -m venv .venv 激活虚拟环境: $ source .venv/bin/activate 安装所需的软件包: (.venv) $ pip install -r requirements.txt 如果在安装问题,请参见。 设置这些环境变量可
【文件预览】:
ezancestry-master
----.gitignore(93B)
----images()
--------opensnp.predicted_ancestries.png(35KB)
--------ezancestry.png(262KB)
----requirements.txt(110B)
----data()
--------Seldin.128AISNP.1kG.vcf(1.27MB)
--------Kidd.55AISNP.1kG.vcf(581KB)
--------integrated_call_samples_v3.20130502.ALL.panel(54KB)
----__init__.py(53B)
----LICENSE(1KB)
----runtime.txt(13B)
----README.md(2KB)
----opensnp_ancestry.py(6KB)
----setup.sh(134B)
----intro.md(1KB)
----Procfile(51B)
----streamlit()
--------__init__.py(0B)
--------util.py(4KB)
--------app.py(8KB)
----details.md(2KB)