文件名称：merlin-auxillary：MERLIN推断网络的下游分析
文件大小：96KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-12 00:07:15
C
梅林下游 MERLIN推断网络的下游分析 制作子样本 randpartitions_with_transpose用于创建子样本。 您可以使用以下表达式在表达式矩阵上运行它： 行上的基因和列上的样本（正常）或 行上的样本和列上的基因（转置）。 假定没有头文件。 所以： 对于正常情况，第一列是基因名称，第一行中没有样品名称 对于转置，第一行是基因名称，第一列中没有样品名称。例如： ./makePartitions trans.txt 100 outdir/ 50 rand transpose trans.txt是转置表达式矩阵 它会创建100个子样本（dataset0.txt至dataset99.txt） 在outdir / 每个样本有50个随机选择的样本。 建立共识网络 estimateedgeconf通过网络文件列表创建共识网络： ./estimateEdgeConf netw
【文件预览】：
merlin-auxillary-master
----estimateedgeconf()
--------Makefile(185B)
--------estimateEdgeConf.C(4KB)
----README.md(2KB)
----assessclusterstab()
--------Makefile(181B)
--------Framework.H(349B)
--------Framework.C(4KB)
----optimalleaforder()
--------OptimalLeafOrder.C(8KB)
--------Distance.H(431B)
--------Heap.C(9KB)
--------Makefile(241B)
--------Heap.H(768B)
--------HierarchicalCluster.C(13KB)
--------Distance.C(1KB)
--------Framework.H(694B)
--------HierarchicalClusterNode.C(373B)
--------HierarchicalClusterNode.H(570B)
--------Framework.C(5KB)
--------HierarchicalCluster.H(2KB)
--------OptimalLeafOrder.H(992B)
----randpartitions_with_transpose_v2()
--------example.txt(394B)
--------Makefile(176B)
--------example_trans()
--------makePartitions(173KB)
--------example_norm()
--------README.txt(2KB)
--------partitionData.C(9KB)
----randpartitions_with_transpose()
--------Makefile(176B)
--------.test.cpp.un~(6KB)
--------partitionData.C(9KB)