【文件属性】：
文件名称：covidtracker:COVID追踪器
文件大小：1.44MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-03-13 03:48:43
JupyterNotebook
COVID追踪器CA
的构建集中在加州，使用公共全球共享禽流感数据倡议组织序列。 包含：
所有CA序列
BLAST中来自世界其他地区的最接近CA的序列
使用标准子采样从世界其他地方选择上下文
然后将最后一棵树修剪成仅CA序列，它们的直接祖先以及具有与直接祖先相同的基因组的上下文序列。 这旨在增强可见性，并专注于CA的介绍和动态。
【文件预览】：
covidtracker-master
----.gitattributes(65B)
----auspice()
--------covidtracker_ca.json(133B)
--------covidtracker_czb.json(14.26MB)
--------covidtracker_pawnee-examples.json(858KB)
----narratives()
--------infection_tree_alignment.png(303KB)
--------pawnee.jpg(135KB)
--------infection_tree.png(726KB)
--------covidtracker_pawnee-interpretation-examples.md(21KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(525B)
----lineage_counts()
--------lineage_line_list.csv(422KB)
--------lineage_counts.csv(57KB)
--------fetch-format-lineage-counts.ipynb(8KB)