enzyme-cost-minimization:Matlab代码和数据,可将酶的成本降至最低

时间:2024-05-19 09:42:29
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文件名称:enzyme-cost-minimization:Matlab代码和数据,可将酶的成本降至最低

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更新时间:2024-05-19 09:42:29

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酶成本最小化 (ECM)是一种预测代谢系统中最佳代谢物和酶浓度的方法。 该存储库包含ECM的Matlab代码。 Elad Noor提供了的。 如果您在工作中使用ECM,请引用我们的Noor等人的文章。 (2016年) (请参见下面的内容)。 Matlab依赖 对于某些MATLAB函数,必须安装以下MATLAB工具箱 (可选-仅在使用SBML文件时才需要) (仅在设置了ecm_options.compute_hessian选项时才需要) 克隆以下存储库 实用程序功能 -代谢网络工具箱 -SBtab工具箱 确保所有目录和子目录都包含在您的Matlab路径中 以下软件包是Metabolic Networks Toolbox的可选依赖项,但未在“酶成本最小化”中使用 执照 该软件包是根据发行的。 接触 如有任何疑问或意见,请联系Wolfram Liebermeister 。 参考 E.


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