文件名称:xheinz:跨物种模块发现
文件大小:66.59MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-19 04:13:58
C++
软件说明 xHeinz是一个软件求解器,用于搜索两个物种之间守恒的活动子网络模块。 它使用分支和切割算法来找到可证明的最优或接近最优的解决方案。 活动子网模块是一组基因,每个物种一个,其中: 在特定物种的相互作用网络中诱导连接的子网络, 显示整体差异行为,以及 含有大量直系同源基因。 编译说明 依赖关系 提升 (>= 1.49) 柠檬 1.3 ILOG CPLEX(> = 12.0) 支持 C++11 的编译器 MacOS X 10.9 和 10.8.5 安装说明 在 Mavericks 中,默认的 C++ 标准库是 libc++ 而不是 libstdc++。 由于 CPLEX 库使用 libstdc++,我们也*使用它。 但是,提供的 Clang 编译器在使用 libstdc++ 时无法编译 C++11 代码。 这就是我们求助于 gcc 4.8 的原因。 通过自制软件安装