文件名称：F1变异模拟：在不同的遗传结构和选择参数下模拟F1变异
文件大小：17KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-02 19:59:51
R
F1变体模拟 该项目使用Admixem在各种遗传结构和选择参数下模拟F1杂种，并将变异系数与亲本物种的变异系数进行比较。 有关安装和运行Admixem的说明，请参见： ：//github.com/melop/admixem。 接下来，决策树（ ）用于预测哪些遗传结构和选择参数更可能导致F1杂种的变异系数比亲本种类。 该存储库中的文件仅模拟一组遗传结构。 具体而言，其中一个目标表型由10个独立的非附加基因座决定，分布在10个独立的染色体中，每个染色体的效应大小为0.1，并且没有自然选择或有性选择。 有关模拟的各种参数组合，请参阅parameters_simulated.xlsx，有关结果，请参见F1_variation_markdown.Rmd。 ＃首先通过安装Admixem开始按照说明安装Admixem ＃配置输入文件请按照说明配置输入文件 Admixem需要许多输入文件。 其中
【文件预览】：
F1-variation-simulations-main
----prop_overlap.R(2KB)
----recombination_hotspots.txt(19KB)
----phenotype_parser3.R(9KB)
----decision_trees.R(3KB)
----samplegens.txt(3B)
----markers.txt(3KB)
----parse_output_df.R(4KB)
----naturalsel_unlinked_additive_esize0.1_noss_nons.txt(64B)
----README.md(5KB)
----phenotype_parser4.R(13KB)
----genes_unlinked_additive_esize0.1_noss_nons.txt(807B)
----phenotypes_unlinked_additive_esize0.1_noss_nons.txt(248B)
----increment_genes.R(497B)
----sexualsel_unlinked_additive_esize0.1_noss_nons.txt(69B)
----loop_admixem_unlinked_additive_esize0.1_noss_nons.bash(4KB)
----admixsimul_unlinked_additive_esize0.1_noss_nons.txt(2KB)