Tutorial7-Metaphlan:Metaphlan 使用教程

时间:2024-06-26 17:54:50
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文件名称:Tutorial7-Metaphlan:Metaphlan 使用教程

文件大小:11KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-26 17:54:50

Shell

Tutorial7-Metaphlan Metaphlan 使用教程 将 GitHub 存储库克隆到主文件夹中 在主文件夹中创建一个名为 VirtualPy 的文件夹,其中包含 requirements.txt 文件 通过键入 ./configure_metaphlan.sh 运行 configure_metaphlan.sh 这将创建一个 Python 虚拟环境,其中包含运行 MetaPhlAn 所需的所有模块。有关虚拟环境的更多信息,请参见下文 在 Tutorial7-Metaphlan 目录中从 Internet 下载 MetaPhlAn hg clone ssh://hg@bitbucket.org/nsegata/metaphlan 通过键入 qsub "".txt 运行 datafastq.txt 以填充数据目录 运行 MetaBowtie2.txt 运行 Bowtie 并


【文件预览】:
Tutorial7-Metaphlan-master
----Graphics4.txt(1KB)
----requirements.txt(149B)
----configure_metaphlan.sh(857B)
----LICENSE(18KB)
----README.md(952B)
----MetaBowtie2.txt(1KB)
----datafastq.txt(1KB)

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