文件名称:发现者
文件大小:69.88MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-08 05:19:24
Perl
欢迎来到FINDER finder是一种基因注释程序管道,可自动下载短读,对齐它们并使用组装的转录本生成基因注释的过程。 另外,它使用蛋白质序列并通过BRAKER2报告基因预测。 它是一种快速,可扩展,独立于平台的软件,可生成GTF格式的基因注释。 finder通过命令行界面接受输入。 它发现了几个新的基因/转录本,还报告了它们所处的组织/状况。如果您使用FINDER进行研究,请引用 Sagnik Banerjee,Priyanka Bhandary,Margaret Woodhouse,Taner Z Sen,Roger P Wise和Carson M Andorf。 FINDER:一种自动软件包,可从RNA-Seq数据和相关蛋白质序列注释真核基因.bioRxiv,第2021.02.04.429837页,2 2021。 安装 finder需要安装许多软件。 这可能会导致与系统中已经安装