rOMT:规范化的最佳质量运输

时间:2024-04-17 05:29:34
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文件名称:rOMT:规范化的最佳质量运输

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更新时间:2024-04-17 05:29:34

正则化最佳质量传输(rOMT)在淋巴-淋巴液流中的应用 该项目包括用于(1)rOMT算法(2)淋巴动力学的拉格朗日表示法(GLaD)分析(3)基于邻域的余弦分析(NCA) (1)在数据集上运行主要的rOMT模型,(2-3)对(1)的结果进行后处理。 系统要求 该代码主要是用Matlab编写和运行的(ROMT算法使用R2018a,后处理使用R2019b),而GLaD分析中的一小部分使用Python 3.7.3运行。 依存关系 Matlab的 (a)NIfTI_analyze 用于加载和导出漂亮的文件(b)vtkwrite 用于将mat导出为vtk格式 Python numpy,scipy,dipy 推荐的可视化软件 (a)阿米拉6.5.0的速度图(b)用于通量向量的VisIt 3.0.2 演示版 原始的3D MRI数据集(每个大小为100x106x100,共11帧)太耗时且占用大量内存,


【文件预览】:
rOMT-main
----LICENSE(34KB)
----pipeline.png(3.47MB)
----README.md(4KB)

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