文件名称：schist:嵌套随机块模型的接口，用于单细胞分析
文件大小：725KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-09 09:42:11
clustering single-cell Python
SCHIST 嵌套随机块模型的接口，用于单细胞分析。 地位 0.7.6版修复了一些错误，并引入了更多错误。 另外，更好地处理亲和力和边缘性 版本0.7.4现在，所有函数都已多次初始化，并且从中计算出边际。 版本0.7.2现在可以运行leiden聚类了，但是它执行了很多次（默认为100），计算出一个共识以及聚类分配的边际。 0.7.0版嵌套模型的计算方式发生了一些变化。 此外，高级功能已被删除， graph_tool应使用graph_tool 完全支持0.6.0版PlantedModel。 此外，数据结构也发生了一些变化（obsm中的关联性） 版本0.5.2用于NSBM（和PP）的快速模型。 版本0.5.0引入了Planted Partition模型 版本0.4.2引入了用于计算群集一致性的函数。 版本0.4.0一些错误修正和名称更改为schist 版本0.3.1可以在先前建
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schist-master
----MANIFEST.in(49B)
----.travis.yml(939B)
----docs()
--------figures()
--------schist.inference.rst(727B)
--------conf.py(2KB)
--------make.bat(795B)
--------schist.tools.rst(824B)
--------intro.rst(5KB)
--------modules.rst(55B)
--------schist.io.rst(313B)
--------schist.rst(675B)
--------schist.plotting.rst(686B)
--------plotting.rst(3KB)
--------Makefile(634B)
--------index.rst(142B)
--------quick.rst(3KB)
----conftest.py(931B)
----Advanced.md(7KB)
----patch.mcmc.txt(492B)
----garnet.png(54KB)
----LICENSE(1KB)
----setup.cfg(226B)
----requirements.txt(44B)
----setup.py(2KB)
----.gitignore(247B)
----README.md(4KB)
----versioneer.py(69KB)
----conftest.sh(257B)
----.gitattributes(32B)
----schist()
--------tools()
--------plotting()
--------_helpers.py(507B)
--------__init__.py(352B)
--------io()
--------inference()
--------_version.py(18KB)
--------_utils.py(7KB)