文件名称：GOexpress-original:Bioconductor 包的原始存储库。 现在在
文件大小：1.82MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-01 05:09:13
R
GO快车 使用基因本体注释可视化微阵列和 RNAseq 数据。 概述 该软件包旨在分析基于基因表达测量的生物信息学数据。 它需要两个输入值： 一个包含检测数据和现象数据的表达式集。 AssayData 槽应该是一个逐个样本的矩阵，提供每个样本（列）中基因（行）的表达水平。 行名称预计是 Ensembl 基因标识符或存在于 Ensembl BioMart 数据集查询中的微阵列中的探针组标识符。 phenoData 槽应该是来自 Biobase 包的 AnnotatedDataFrame，提供有关样本的表型信息。 行名是样本，至少其中一列必须是两级或多级的分组因子（R语言实际含义中的因子）。 要调查的分组因子的名称，它必须是 phenoData 中的有效列名。 该分析使用 biomaRt 包对提供的基因注释中表示的所有基因本体 (GO) 术语进行评分，或从当前的 Ensembl 注释版本
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GOexpress-original-master
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