文件名称:mmmTMB:R软件包,适合使用TMB的Markov运动模型
文件大小:100KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-06 09:09:32
R
mmmTMB 通过模板模型生成器来适合Markov运动模型(MMM)的R包 安装 mmmTMB软件包的安装和使用需要,理想情况下具有OpenMP支持。 devtools :: install_github( " luke-a-rogers/mmmTMB " )
【文件预览】:
mmmTMB-master
----vignettes()
--------fit-to-sim.Rmd(755B)
--------.gitignore(11B)
----mmmTMB.Rproj(395B)
----NAMESPACE(495B)
----DESCRIPTION(852B)
----src()
--------Makevars(76B)
--------Makevars.win(76B)
--------mmmTMB.cpp(9KB)
--------registerDynamicSymbol.c(229B)
--------.gitignore(15B)
----R()
--------sysdata.rda(33KB)
--------data.R(107B)
--------fit.R(19KB)
--------plot.R(10KB)
--------simulate.R(13KB)
--------check.R(10KB)
--------wrangle.R(25KB)
--------convert.R(17KB)
----.travis.yml(236B)
----.Rbuildignore(57B)
----LICENSE.md(34KB)
----README.md(945B)
----data()
--------sim_data.rda(3KB)
----man()
--------create_release_matrix.Rd(872B)
--------mmmRates.Rd(3KB)
--------mmmIndex.Rd(1KB)
--------mmmBarplot.Rd(515B)
--------mmmLineplot.Rd(2KB)
--------mmmHeatmap.Rd(1KB)
--------check_parameters.Rd(337B)
--------mmmTags.Rd(4KB)
--------mmmFit.Rd(3KB)
--------matrix_power.Rd(471B)
--------create_bias_results.Rd(550B)
--------subset_by_name.Rd(475B)
--------sensibly_round.Rd(389B)
--------mmmSet.Rd(2KB)
--------create_movement_rates.Rd(956B)
--------check_data.Rd(302B)
--------mmmGroup.Rd(736B)
--------create_mortality_results.Rd(729B)
--------create_fishing_results.Rd(899B)
--------create_movement_parameters.Rd(988B)
--------mmmControl.Rd(529B)
--------create_movement_results.Rd(1KB)
--------get_convergence_diagnostics.Rd(576B)
--------mmmWeights.Rd(906B)
--------logit.Rd(459B)
--------invlogit.Rd(426B)
--------check_settings.Rd(323B)
--------create_dispersion_results.Rd(571B)
--------sim_data.Rd(295B)
--------mmmSim.Rd(3KB)
----tests()
--------testthat()
--------testthat.R(56B)
----.gitignore(156B)
----data-raw()
--------sysdata.R(999B)
--------sim_data.R(820B)
----README.Rmd(1KB)